Detalles de la búsqueda
1.
Use of Extended-Hückel Descriptors for Rapid and Accurate Predictions of Conjugated Torsional Energy Barriers.
J Chem Inf Model
; 60(7): 3534-3545, 2020 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32589419
2.
Atom Type Independent Modeling of the Conformational Energy of Benzylic, Allylic, and Other Bonds Adjacent to Conjugated Systems.
J Chem Inf Model
; 59(11): 4750-4763, 2019 11 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31589815
3.
Torsional Energy Barriers of Biaryls Could Be Predicted by Electron Richness/Deficiency of Aromatic Rings; Advancement of Molecular Mechanics toward Atom-Type Independence.
J Chem Inf Model
; 59(11): 4764-4777, 2019 11 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31430147
4.
Atom Types Independent Molecular Mechanics Method for Predicting the Conformational Energy of Small Molecules.
J Chem Inf Model
; 58(1): 194-205, 2018 01 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29253333
5.
Elucidating Hyperconjugation from Electronegativity to Predict Drug Conformational Energy in a High Throughput Manner.
J Chem Inf Model
; 56(4): 788-801, 2016 04 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27028941
6.
Understanding P450-mediated Bio-transformations into Epoxide and Phenolic Metabolites.
Angew Chem Int Ed Engl
; 54(46): 13743-7, 2015 Nov 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26418278
7.
Assessment of fully automated antibody homology modeling protocols in molecular operating environment.
Proteins
; 82(8): 1599-610, 2014 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24715627
8.
AMBER Free Energy Tools: A New Framework for the Design of Optimized Alchemical Transformation Pathways.
J Chem Theory Comput
; 2023 Jan 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36622640
9.
Variability in docking success rates due to dataset preparation.
J Comput Aided Mol Des
; 26(6): 775-86, 2012 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22566074
10.
Antibody modeling assessment.
Proteins
; 79(11): 3050-66, 2011 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21935986
11.
Structure-based charge calculations for predicting isoelectric point, viscosity, clearance, and profiling antibody therapeutics.
MAbs
; 13(1): 1981805, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34632944
12.
LowModeMD--implicit low-mode velocity filtering applied to conformational search of macrocycles and protein loops.
J Chem Inf Model
; 50(5): 792-800, 2010 May 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20429574
13.
Training a scoring function for the alignment of small molecules.
J Chem Inf Model
; 50(9): 1724-35, 2010 Sep 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20831240
14.
Pocket similarity: are alpha carbons enough?
J Chem Inf Model
; 50(8): 1466-75, 2010 Aug 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20690656
15.
Protonate3D: assignment of ionization states and hydrogen coordinates to macromolecular structures.
Proteins
; 75(1): 187-205, 2009 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18814299
16.
The generalized Born/volume integral implicit solvent model: estimation of the free energy of hydration using London dispersion instead of atomic surface area.
J Comput Chem
; 29(10): 1693-8, 2008 Jul 30.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18307169
17.
Methods of Exploring Protein-Ligand Interactions to Guide Medicinal Chemistry Efforts.
Methods Mol Biol
; 1705: 159-177, 2018.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29188562
18.
A probabilistic approach to high throughput drug discovery.
Comb Chem High Throughput Screen
; 5(2): 135-45, 2002 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-11966422
19.
Derivation and applications of molecular descriptors based on approximate surface area.
Methods Mol Biol
; 275: 261-78, 2004.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-15141115
20.
A Cavity Corrected 3D-RISM Functional for Accurate Solvation Free Energies.
J Chem Theory Comput
; 10(3): 934-941, 2014 Mar 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24634616