Detalles de la búsqueda
1.
Clair3-trio: high-performance Nanopore long-read variant calling in family trios with trio-to-trio deep neural networks.
Brief Bioinform
; 23(5)2022 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35849103
2.
Boosting variant-calling performance with multi-platform sequencing data using Clair3-MP.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 308, 2023 Aug 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37537536
3.
Duet: SNP-assisted structural variant calling and phasing using Oxford nanopore sequencing.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 465, 2022 Nov 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36344913
4.
MegaPath: sensitive and rapid pathogen detection using metagenomic NGS data.
BMC Genomics
; 21(Suppl 6): 500, 2020 Dec 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33349238
5.
AC-DIAMOND v1: accelerating large-scale DNA-protein alignment.
Bioinformatics
; 34(21): 3744-3746, 2018 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29771282
6.
MegaGTA: a sensitive and accurate metagenomic gene-targeted assembler using iterative de Bruijn graphs.
BMC Bioinformatics
; 18(Suppl 12): 408, 2017 Oct 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29072142
7.
A simple and economical method for improving whole genome alignment.
BMC Genomics
; 18(Suppl 4): 362, 2017 05 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28589863
8.
MEGAHIT v1.0: A fast and scalable metagenome assembler driven by advanced methodologies and community practices.
Methods
; 102: 3-11, 2016 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27012178
9.
PnpProbs: a better multiple sequence alignment tool by better handling of guide trees.
BMC Bioinformatics
; 17 Suppl 8: 285, 2016 Aug 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27585754
10.
BASE: a practical de novo assembler for large genomes using long NGS reads.
BMC Genomics
; 17 Suppl 5: 499, 2016 08 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27586129
11.
MEGAHIT: an ultra-fast single-node solution for large and complex metagenomics assembly via succinct de Bruijn graph.
Bioinformatics
; 31(10): 1674-6, 2015 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25609793
12.
database.bio: a web application for interpreting human variations.
Bioinformatics
; 31(24): 4035-7, 2015 Dec 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26315902
13.
Improving multiple sequence alignment by using better guide trees.
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 5: S4, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25859903
14.
MICA: A fast short-read aligner that takes full advantage of Many Integrated Core Architecture (MIC).
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 7: S10, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25952019
15.
FaSD-somatic: a fast and accurate somatic SNV detection algorithm for cancer genome sequencing data.
Bioinformatics
; 30(17): 2498-500, 2014 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24833803
16.
SOAPdenovo-Trans: de novo transcriptome assembly with short RNA-Seq reads.
Bioinformatics
; 30(12): 1660-6, 2014 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24532719
17.
SOAPfusion: a robust and effective computational fusion discovery tool for RNA-seq reads.
Bioinformatics
; 29(23): 2971-8, 2013 Dec 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24123671
18.
ClusterV-Web: a user-friendly tool for profiling HIV quasispecies and generating drug resistance reports from nanopore long-read data.
Bioinform Adv
; 4(1): vbae006, 2024.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38282975
19.
Development and validation of risk prediction model for recurrent cardiovascular events among Chinese: the Personalized CARdiovascular DIsease risk Assessment for Chinese model.
Eur Heart J Digit Health
; 5(3): 363-370, 2024 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38774379
20.
COPE: an accurate k-mer-based pair-end reads connection tool to facilitate genome assembly.
Bioinformatics
; 28(22): 2870-4, 2012 Nov 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23044551