Detalles de la búsqueda
1.
Benchmarking long-read RNA-sequencing analysis tools using in silico mixtures.
Nat Methods
; 20(11): 1810-1821, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37783886
2.
A functional genetic screen identifies aurora kinase b as an essential regulator of Sox9-positive mouse embryonic lung progenitor cells.
Development
; 148(13)2021 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34121118
3.
Toward a gold standard for benchmarking gene set enrichment analysis.
Brief Bioinform
; 22(1): 545-556, 2021 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32026945
4.
The impact of influenza pulmonary infection and inflammation on vagal bronchopulmonary sensory neurons.
FASEB J
; 35(3): e21320, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33660333
5.
RNA-seq mixology: designing realistic control experiments to compare protocols and analysis methods.
Nucleic Acids Res
; 45(5): e30, 2017 03 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27899618
6.
Glimma: interactive graphics for gene expression analysis.
Bioinformatics
; 33(13): 2050-2052, 2017 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28203714
7.
The hematopoietic oncoprotein FOXP1 promotes tumor cell survival in diffuse large B-cell lymphoma by repressing S1PR2 signaling.
Blood
; 127(11): 1438-48, 2016 Mar 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26729899
8.
limma powers differential expression analyses for RNA-sequencing and microarray studies.
Nucleic Acids Res
; 43(7): e47, 2015 Apr 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25605792
9.
An immunohistochemical atlas of necroptotic pathway expression.
EMBO Mol Med
; 2024 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38750308
10.
Modeling group heteroscedasticity in single-cell RNA-seq pseudo-bulk data.
Genome Biol
; 24(1): 107, 2023 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37147723
11.
Dashboard-style interactive plots for RNA-seq analysis are R Markdown ready with Glimma 2.0.
NAR Genom Bioinform
; 3(4): lqab116, 2021 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34988439
12.
Homeostatic apoptosis prevents competition-induced atrophy in follicular B cells.
Cell Rep
; 36(3): 109430, 2021 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34289356
13.
The long and the short of it: unlocking nanopore long-read RNA sequencing data with short-read differential expression analysis tools.
NAR Genom Bioinform
; 3(2): lqab028, 2021 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33937765
14.
Comprehensive characterization of single-cell full-length isoforms in human and mouse with long-read sequencing.
Genome Biol
; 22(1): 310, 2021 11 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34763716
15.
A guide to creating design matrices for gene expression experiments.
F1000Res
; 9: 1444, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33604029
16.
Covering all your bases: incorporating intron signal from RNA-seq data.
NAR Genom Bioinform
; 2(3): lqaa073, 2020 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33575621
17.
Germline heterozygous mutations in Nxf1 perturb RNA metabolism and trigger thrombocytopenia and lymphopenia in mice.
Blood Adv
; 4(7): 1270-1283, 2020 04 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32236527
18.
Publisher Correction: Modeling group heteroscedasticity in single-cell RNA-seq pseudo-bulk data.
Genome Biol
; 24(1): 112, 2023 May 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37173797
19.
Easy and efficient ensemble gene set testing with EGSEA.
F1000Res
; 6: 2010, 2017.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29333246
20.
Identification of quiescent and spatially restricted mammary stem cells that are hormone responsive.
Nat Cell Biol
; 19(3): 164-176, 2017 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28192422