Detalles de la búsqueda
1.
Understanding the Energy Landscape of Intrinsically Disordered Protein Ensembles.
J Chem Inf Model
; 64(10): 4149-4157, 2024 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38713459
2.
ELViM: Exploring Biomolecular Energy Landscapes through Multidimensional Visualization.
J Chem Inf Model
; 64(8): 3443-3450, 2024 Apr 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38506664
3.
Characterizing the Folding Transition-State Ensembles in the Energy Landscape of an RNA Tetraloop.
J Chem Inf Model
; 63(17): 5641-5649, 2023 09 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37606640
4.
Unveiling Metastable Ensembles of GRB2 and the Relevance of Interdomain Communication during Folding.
J Chem Inf Model
; 63(20): 6344-6353, 2023 10 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37824286
5.
pH and the Breast Cancer Recurrent Mutation D538G Affect the Process of Activation of Estrogen Receptor α.
Biochemistry
; 61(6): 455-463, 2022 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35238537
6.
In silico identification of noncompetitive inhibitors targeting an uncharacterized allosteric site of falcipain-2.
J Comput Aided Mol Des
; 35(10): 1067-1079, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34617191
7.
Water Bridges Play a Key Role in Affinity and Selectivity for Malarial Protease Falcipain-2.
J Chem Inf Model
; 60(11): 5499-5512, 2020 11 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32634311
8.
Rational Design of Chymotrypsin Inhibitor 2 by Optimizing Non-Native Interactions.
J Chem Inf Model
; 60(2): 982-988, 2020 02 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31794216
9.
Diffusion of tRNA inside the ribosome is position-dependent.
J Chem Phys
; 151(8): 085102, 2019 Aug 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31470725
10.
TKSA-MC: A web server for rational mutation through the optimization of protein charge interactions.
Proteins
; 86(11): 1184-1188, 2018 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30218467
11.
Topography of funneled landscapes determines the thermodynamics and kinetics of protein folding.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 109(39): 15763-8, 2012 Sep 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23019359
12.
Capturing transition paths and transition states for conformational rearrangements in the ribosome.
Biophys J
; 107(12): 2881-2890, 2014 Dec 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25517153
13.
Assembling a xylanase-lichenase chimera through all-atom molecular dynamics simulations.
Biochim Biophys Acta
; 1834(8): 1492-500, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23459129
14.
Inferring a weighted elastic network from partial unfolding with coarse-grained simulations.
Proteins
; 82(1): 119-29, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23900877
15.
Probing Mastoparan-like Antimicrobial Peptides Interaction with Model Membrane Through Energy Landscape Analysis.
J Phys Chem B
; 128(1): 163-171, 2024 Jan 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38159056
16.
Analyzing the effect of homogeneous frustration in protein folding.
Proteins
; 81(10): 1727-37, 2013 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23609962
17.
Exploring the Folding Mechanism of Dimeric Superoxide Dismutase.
J Phys Chem B
; 127(6): 1338-1349, 2023 02 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36716437
18.
Probing the Energy Landscape of Spectrin R15 and R16 and the Effects of Non-native Interactions.
J Phys Chem B
; 127(6): 1291-1300, 2023 02 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36723393
19.
Coarse-Grained Simulations of Protein Folding: Bridging Theory and Experiments.
Methods Mol Biol
; 2376: 303-315, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34845616
20.
Resolving the fine structure in the energy landscapes of repeat proteins.
QRB Discov
; 3: e7, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37529289