Detalles de la búsqueda
1.
Correction: A three-dimensional RNA motif mediates directional trafficking of Potato spindle tuber viroid from epidermal to palisade mesophyll cells in Nicotiana benthamiana.
PLoS Pathog
; 18(3): e1010421, 2022 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35316309
2.
Context-sensitivity of isosteric substitutions of non-Watson-Crick basepairs in recurrent RNA 3D motifs.
Nucleic Acids Res
; 49(16): 9574-9593, 2021 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34403481
3.
An RNA-centric historical narrative around the Protein Data Bank.
J Biol Chem
; 296: 100555, 2021.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33744291
4.
Functional analysis reveals G/U pairs critical for replication and trafficking of an infectious non-coding viroid RNA.
Nucleic Acids Res
; 48(6): 3134-3155, 2020 04 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32083649
5.
A three-dimensional RNA motif mediates directional trafficking of Potato spindle tuber viroid from epidermal to palisade mesophyll cells in Nicotiana benthamiana.
PLoS Pathog
; 15(10): e1008147, 2019 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31644572
6.
Corrigendum: Functional analysis reveals G/U pairs critical for replication and trafficking of an infectious non-coding viroid RNA.
Nucleic Acids Res
; 49(1): 596-598, 2021 01 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33313761
7.
The RNA 3D Motif Atlas: Computational methods for extraction, organization and evaluation of RNA motifs.
Methods
; 103: 99-119, 2016 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27125735
8.
Identifying novel sequence variants of RNA 3D motifs.
Nucleic Acids Res
; 43(15): 7504-20, 2015 Sep 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26130723
9.
The Nucleic Acid Database: new features and capabilities.
Nucleic Acids Res
; 42(Database issue): D114-22, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24185695
10.
Automated classification of RNA 3D motifs and the RNA 3D Motif Atlas.
RNA
; 19(10): 1327-40, 2013 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23970545
11.
RNA 3-dimensional structural motifs as a critical constraint of viroid RNA evolution.
PLoS Pathog
; 14(2): e1006801, 2018 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29470541
12.
R3D Align web server for global nucleotide to nucleotide alignments of RNA 3D structures.
Nucleic Acids Res
; 41(Web Server issue): W15-21, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23716643
13.
RNA-Puzzles: a CASP-like evaluation of RNA three-dimensional structure prediction.
RNA
; 18(4): 610-25, 2012 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22361291
14.
A three-dimensional RNA motif in Potato spindle tuber viroid mediates trafficking from palisade mesophyll to spongy mesophyll in Nicotiana benthamiana.
Plant Cell
; 23(1): 258-72, 2011 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21258006
15.
Comprehensive survey and geometric classification of base triples in RNA structures.
Nucleic Acids Res
; 40(4): 1407-23, 2012 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22053086
16.
Sharing and archiving nucleic acid structure mapping data.
RNA
; 17(7): 1204-12, 2011 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21610212
17.
WebFR3D--a server for finding, aligning and analyzing recurrent RNA 3D motifs.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W50-5, 2011 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21515634
18.
Engineering cooperative tecto-RNA complexes having programmable stoichiometries.
Nucleic Acids Res
; 39(7): 2903-17, 2011 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21138969
19.
Molecular dynamics simulations suggest that RNA three-way junctions can act as flexible RNA structural elements in the ribosome.
Nucleic Acids Res
; 38(18): 6247-64, 2010 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20507916
20.
R3D Align: global pairwise alignment of RNA 3D structures using local superpositions.
Bioinformatics
; 26(21): 2689-97, 2010 Nov 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20929913