Detalles de la búsqueda
1.
On the excessive use of coefficient of variation as a metric of quantitation quality in proteomics.
Proteomics
; 24(1-2): e2300090, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37496303
2.
Proteomics-based scoring of cellular response to stimuli for improved characterization of signaling pathway activity.
Proteomics
; 23(5): e2200275, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36478387
3.
Unified and Standardized Mass Spectrometry Data Processing in Python Using spectrum_utils.
J Proteome Res
; 22(2): 625-631, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36688502
4.
IQMMA: Efficient MS1 Intensity Extraction Pipeline Using Multiple Feature Detection Algorithms for DDA Proteomics.
J Proteome Res
; 22(9): 2827-2835, 2023 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37579078
5.
Massive Proteogenomic Reanalysis of Publicly Available Proteomic Datasets of Human Tissues in Search for Protein Recoding via Adenosine-to-Inosine RNA Editing.
J Proteome Res
; 22(6): 1695-1711, 2023 06 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37158322
6.
Identification of Alternative Splicing in Proteomes of Human Melanoma Cell Lines without RNA Sequencing Data.
Int J Mol Sci
; 24(3)2023 Jan 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36768787
7.
A Comprehensive Evaluation of Consensus Spectrum Generation Methods in Proteomics.
J Proteome Res
; 21(6): 1566-1574, 2022 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35549218
8.
Validating Amino Acid Variants in Proteogenomics Using Sequence Coverage by Multiple Reads.
J Proteome Res
; 21(6): 1438-1448, 2022 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35536917
9.
DirectMS1Quant: Ultrafast Quantitative Proteomics with MS/MS-Free Mass Spectrometry.
Anal Chem
; 94(38): 13068-13075, 2022 09 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36094425
10.
Proteomic Analysis of Zebrafish Protein Recoding via mRNA Editing by ADAR Enzymes.
Biochemistry (Mosc)
; 87(11): 1301-1309, 2022 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36509721
11.
Proteome-Wide Analysis of ADAR-Mediated Messenger RNA Editing during Fruit Fly Ontogeny.
J Proteome Res
; 19(10): 4046-4060, 2020 10 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32866021
12.
DirectMS1: MS/MS-Free Identification of 1000 Proteins of Cellular Proteomes in 5 Minutes.
Anal Chem
; 92(6): 4326-4333, 2020 03 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32077687
13.
Scavager: A Versatile Postsearch Validation Algorithm for Shotgun Proteomics Based on Gradient Boosting.
Proteomics
; 19(3): e1800280, 2019 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30537264
14.
Adenosine-to-Inosine RNA Editing in Mouse and Human Brain Proteomes.
Proteomics
; 19(23): e1900195, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31576663
15.
Pyteomics 4.0: Five Years of Development of a Python Proteomics Framework.
J Proteome Res
; 18(2): 709-714, 2019 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30576148
16.
Validation of Peptide Identification Results in Proteomics Using Amino Acid Counting.
Proteomics
; 18(23): e1800117, 2018 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30307114
17.
IdentiPy: An Extensible Search Engine for Protein Identification in Shotgun Proteomics.
J Proteome Res
; 17(7): 2249-2255, 2018 07 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29682971
18.
FractionOptimizer: a method for optimal peptide fractionation in bottom-up proteomics.
Anal Bioanal Chem
; 410(16): 3827-3833, 2018 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29663059
19.
Unbiased False Discovery Rate Estimation for Shotgun Proteomics Based on the Target-Decoy Approach.
J Proteome Res
; 16(2): 393-397, 2017 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27959540
20.
MS/MS-Free Protein Identification in Complex Mixtures Using Multiple Enzymes with Complementary Specificity.
J Proteome Res
; 16(11): 3989-3999, 2017 11 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28905631