Detalles de la búsqueda
1.
Expanding the Library of 1,2,4-Oxadiazole Derivatives: Discovery of New Farnesoid X Receptor (FXR) Antagonists/Pregnane X Receptor (PXR) Agonists.
Molecules
; 28(6)2023 Mar 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36985811
2.
Discovery of Bile Acid Derivatives as Potent ACE2 Activators by Virtual Screening and Essential Dynamics.
J Chem Inf Model
; 62(1): 196-209, 2022 01 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34914393
3.
DDT - Drug Discovery Tool: a fast and intuitive graphics user interface for docking and molecular dynamics analysis.
Bioinformatics
; 35(24): 5328-5330, 2019 12 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31304963
4.
Ligand binding to telomeric G-quadruplex DNA investigated by funnel-metadynamics simulations.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(11): E2136-E2145, 2017 03 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28232513
5.
Structural Insight into the Binding Mode of FXR and GPBAR1 Modulators.
Handb Exp Pharmacol
; 256: 111-136, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31161298
6.
Introduction of Nonacidic Side Chains on 6-Ethylcholane Scaffolds in the Identification of Potent Bile Acid Receptor Agonists with Improved Pharmacokinetic Properties.
Molecules
; 24(6)2019 Mar 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30884797
7.
Disruption of TFGß-SMAD3 pathway by the nuclear receptor SHP mediates the antifibrotic activities of BAR704, a novel highly selective FXR ligand.
Pharmacol Res
; 131: 17-31, 2018 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29530598
8.
Kinetics of protein-ligand unbinding: Predicting pathways, rates, and rate-limiting steps.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(5): E386-91, 2015 Feb 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25605901
9.
Unbinding Kinetics of a p38 MAP Kinase Type II Inhibitor from Metadynamics Simulations.
J Am Chem Soc
; 139(13): 4780-4788, 2017 04 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28290199
10.
Conformational Changes in the Epidermal Growth Factor Receptor: Role of the Transmembrane Domain Investigated by Coarse-Grained MetaDynamics Free Energy Calculations.
J Am Chem Soc
; 138(33): 10611-22, 2016 08 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27459426
11.
Mechanistic insight into ligand binding to G-quadruplex DNA.
Nucleic Acids Res
; 42(9): 5447-55, 2014 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24753420
12.
G-triplex structure and formation propensity.
Nucleic Acids Res
; 42(21): 13393-404, 2014 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25378342
13.
Funnel metadynamics as accurate binding free-energy method.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(16): 6358-63, 2013 Apr 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23553839
14.
Funnel-metadynamics and solution NMR to estimate protein-ligand affinities.
J Am Chem Soc
; 137(3): 1273-81, 2015 Jan 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25551252
15.
Sampling protein motion and solvent effect during ligand binding.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 109(5): 1467-72, 2012 Jan 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22238423
16.
Marine and semi-synthetic hydroxysteroids as new scaffolds for pregnane X receptor modulation.
Mar Drugs
; 12(6): 3091-115, 2014 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24871460
17.
Molecular basis of cyclooxygenase enzymes (COXs) selective inhibition.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(12): 5411-6, 2010 Mar 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20215464
18.
Perspectives on Ligand/Protein Binding Kinetics Simulations: Force Fields, Machine Learning, Sampling, and User-Friendliness.
J Chem Theory Comput
; 19(18): 6047-6061, 2023 Sep 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37656199
19.
Transferring chemical and energetic knowledge between molecular systems with machine learning.
Commun Chem
; 6(1): 13, 2023 Jan 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36697971
20.
Conformational plasticity and allosteric communication networks explain Shelterin protein TPP1 binding to human telomerase.
Commun Chem
; 6(1): 242, 2023 Nov 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37935941