Detalles de la búsqueda
1.
EDGE COVID-19: a web platform to generate submission-ready genomes from SARS-CoV-2 sequencing efforts.
Bioinformatics
; 38(10): 2700-2704, 2022 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35561186
2.
A public website for the automated assessment and validation of SARS-CoV-2 diagnostic PCR assays.
Bioinformatics
; 37(7): 1024-1025, 2021 05 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32777813
3.
Uncovering the Core Microbiome and Distribution of Palmerolide in Synoicum adareanum Across the Anvers Island Archipelago, Antarctica.
Mar Drugs
; 18(6)2020 Jun 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32498449
4.
Enabling the democratization of the genomics revolution with a fully integrated web-based bioinformatics platform.
Nucleic Acids Res
; 45(1): 67-80, 2017 01 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27899609
5.
"Candidatus Nitrosotenuis aquarius," an Ammonia-Oxidizing Archaeon from a Freshwater Aquarium Biofilter.
Appl Environ Microbiol
; 84(19)2018 10 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29959256
6.
ADEPT, a dynamic next generation sequencing data error-detection program with trimming.
BMC Bioinformatics
; 17: 109, 2016 Feb 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26928302
7.
Nearly finished genomes produced using gel microdroplet culturing reveal substantial intraspecies genomic diversity within the human microbiome.
Genome Res
; 23(5): 878-88, 2013 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23493677
8.
Adaptation genomics of a small-colony variant in a Pseudomonas chlororaphis 30-84 biofilm.
Appl Environ Microbiol
; 81(3): 890-9, 2015 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25416762
9.
A programmable droplet-based microfluidic device applied to multiparameter analysis of single microbes and microbial communities.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 109(20): 7665-70, 2012 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22547789
10.
Rapid evaluation and quality control of next generation sequencing data with FaQCs.
BMC Bioinformatics
; 15: 366, 2014 Nov 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25408143
11.
Recommendations for Uniform Variant Calling of SARS-CoV-2 Genome Sequence across Bioinformatic Workflows.
Viruses
; 16(3)2024 03 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38543795
12.
Genomic and Phenotypic Characterization of Shiga Toxin-Producing Escherichia albertii Strains Isolated from Wild Birds in a Major Agricultural Region in California.
Microorganisms
; 11(11)2023 Nov 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38004814
13.
Bridging Place-Based Astrobiology Education with Genomics, Including Descriptions of Three Novel Bacterial Species Isolated from Mars Analog Sites of Cultural Relevance.
Astrobiology
; 23(12): 1348-1367, 2023 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38079228
14.
Comparative Genomics Applied to Systematically Assess Pathogenicity Potential in Shiga Toxin-Producing Escherichia coli O145:H28.
Microorganisms
; 10(5)2022 Apr 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35630311
15.
Precise Genomic Riboregulator Control of Metabolic Flux in Microbial Systems.
ACS Synth Biol
; 11(10): 3216-3227, 2022 10 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36130255
16.
Towards increased accuracy and reproducibility in SARS-CoV-2 next generation sequence analysis for public health surveillance.
bioRxiv
; 2022 Nov 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36380755
17.
Benchmark datasets for SARS-CoV-2 surveillance bioinformatics.
PeerJ
; 10: e13821, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36093336
18.
Discovery of an Antarctic Ascidian-Associated Uncultivated Verrucomicrobia with Antimelanoma Palmerolide Biosynthetic Potential.
mSphere
; 6(6): e0075921, 2021 12 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34851164
19.
Bioinformatic and Mechanistic Analysis of the Palmerolide PKS-NRPS Biosynthetic Pathway From the Microbiome of an Antarctic Ascidian.
Front Chem
; 9: 802574, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35004620
20.
Challenges in Bioinformatics Workflows for Processing Microbiome Omics Data at Scale.
Front Bioinform
; 1: 826370, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36303775