Detalles de la búsqueda
1.
Model certainty in cellular network-driven processes with missing data.
PLoS Comput Biol
; 19(4): e1011004, 2023 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37099625
2.
Unified tumor growth mechanisms from multimodel inference and dataset integration.
PLoS Comput Biol
; 19(7): e1011215, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37406008
3.
A biochemical necroptosis model explains cell-type-specific responses to cell death cues.
Biophys J
; 122(5): 817-834, 2023 03 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36710493
4.
Microbench: automated metadata management for systems biology benchmarking and reproducibility in Python.
Bioinformatics
; 38(20): 4823-4825, 2022 10 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36000837
5.
Thunor: visualization and analysis of high-throughput dose-response datasets.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W633-W640, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34038546
6.
Unsupervised logic-based mechanism inference for network-driven biological processes.
PLoS Comput Biol
; 17(6): e1009035, 2021 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34077417
7.
Arrestin-3 scaffolding of the JNK3 cascade suggests a mechanism for signal amplification.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(3): 810-815, 2019 01 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30591558
8.
Systems-level network modeling of Small Cell Lung Cancer subtypes identifies master regulators and destabilizers.
PLoS Comput Biol
; 15(10): e1007343, 2019 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31671086
9.
Cardiolipin-Dependent Properties of Model Mitochondrial Membranes from Molecular Simulations.
Biophys J
; 117(3): 429-444, 2019 08 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31349988
10.
An unbiased metric of antiproliferative drug effect in vitro.
Nat Methods
; 13(6): 497-500, 2016 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27135974
11.
PyDREAM: high-dimensional parameter inference for biological models in python.
Bioinformatics
; 34(4): 695-697, 2018 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29028896
12.
GPU-powered model analysis with PySB/cupSODA.
Bioinformatics
; 33(21): 3492-3494, 2017 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28666314
13.
Activated Oncogenic Pathway Modifies Iron Network in Breast Epithelial Cells: A Dynamic Modeling Perspective.
PLoS Comput Biol
; 13(2): e1005352, 2017 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28166223
14.
Competition and allostery govern substrate selectivity of cyclooxygenase-2.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(40): 12366-71, 2015 Oct 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26392530
15.
Integrated, High-Throughput, Multiomics Platform Enables Data-Driven Construction of Cellular Responses and Reveals Global Drug Mechanisms of Action.
J Proteome Res
; 16(3): 1364-1375, 2017 03 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28088864
16.
Potentiation of antifungal effect of a mixture of two antifungal fractions obtained from Baccharis glutinosa and Jacquinia macrocarpa plants.
J Environ Sci Health B
; 51(11): 760-8, 2016 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27382921
17.
Programming biological models in Python using PySB.
Mol Syst Biol
; 9: 646, 2013.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23423320
18.
Signal execution modes emerge in biochemical reaction networks calibrated to experimental data.
iScience
; 27(6): 109989, 2024 Jun 21.
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| MEDLINE | ID: mdl-38846004
19.
Data-driven structural analysis of Small Cell Lung Cancer transcription factor network suggests potential subtype regulators and transition pathways.
bioRxiv
; 2023 Apr 03.
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| MEDLINE | ID: mdl-37066351
20.
Data-driven structural analysis of small cell lung cancer transcription factor network suggests potential subtype regulators and transition pathways.
NPJ Syst Biol Appl
; 9(1): 55, 2023 Oct 31.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37907529