Detalles de la búsqueda
1.
DSSR-enabled innovative schematics of 3D nucleic acid structures with PyMOL.
Nucleic Acids Res
; 48(13): e74, 2020 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32442277
2.
Web 3DNA 2.0 for the analysis, visualization, and modeling of 3D nucleic acid structures.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W26-W34, 2019 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31114927
3.
DNA Conformational Changes Play a Force-Generating Role during Bacteriophage Genome Packaging.
Biophys J
; 116(11): 2172-2180, 2019 06 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31103227
4.
Effects of Noncanonical Base Pairing on RNA Folding: Structural Context and Spatial Arrangements of G·A Pairs.
Biochemistry
; 58(20): 2474-2487, 2019 05 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31008589
5.
DSSR-enhanced visualization of nucleic acid structures in Jmol.
Nucleic Acids Res
; 45(W1): W528-W533, 2017 07 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28472503
6.
DSSR: an integrated software tool for dissecting the spatial structure of RNA.
Nucleic Acids Res
; 43(21): e142, 2015 Dec 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26184874
7.
Structure-based prediction and characterization of photo-crosslinking in native protein-RNA complexes.
Nat Commun
; 15(1): 2279, 2024 Mar 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38480694
8.
Weak operator binding enhances simulated Lac repressor-mediated DNA looping.
Biopolymers
; 99(12): 1070-81, 2013 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23818216
9.
The RNA backbone plays a crucial role in mediating the intrinsic stability of the GpU dinucleotide platform and the GpUpA/GpA miniduplex.
Nucleic Acids Res
; 38(14): 4868-76, 2010 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20223772
10.
3DNALandscapes: a database for exploring the conformational features of DNA.
Nucleic Acids Res
; 38(Database issue): D267-74, 2010 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19906722
11.
[Measuring soil water content by using near infrared spectral characteristics of soil].
Guang Pu Xue Yu Guang Pu Fen Xi
; 32(8): 2117-21, 2012 Aug.
Artículo
en Zh
| MEDLINE | ID: mdl-23156763
12.
Web 3DNA--a web server for the analysis, reconstruction, and visualization of three-dimensional nucleic-acid structures.
Nucleic Acids Res
; 37(Web Server issue): W240-6, 2009 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19474339
13.
New restraints and validation approaches for nucleic acid structures in PDB-REDO.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 77(Pt 9): 1127-1141, 2021 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34473084
14.
New information content in RNA base pairing deduced from quantitative analysis of high-resolution structures.
Methods
; 47(3): 177-86, 2009 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19150407
15.
Toward a Mechanistic Understanding of DNA Methylation Readout by Transcription Factors.
J Mol Biol
; 432(6): 1801-1815, 2020 Mar 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31689433
16.
Reduced Gja5 expression in arterial endothelial cells impairs arteriogenesis during acute ischemic cardiovascular disease.
Exp Ther Med
; 14(5): 4339-4343, 2017 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29104646
17.
Parallels between DNA and collagen - comparing elastic models of the double and triple helix.
Sci Rep
; 7(1): 12802, 2017 10 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29038480
18.
3DNA: a software package for the analysis, rebuilding and visualization of three-dimensional nucleic acid structures.
Nucleic Acids Res
; 31(17): 5108-21, 2003 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12930962
19.
DNA Scrunching in the Packaging of Viral Genomes.
J Phys Chem B
; 120(26): 6200-7, 2016 07 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27214211
20.
Transitions of Double-Stranded DNA Between the A- and B-Forms.
J Phys Chem B
; 120(33): 8449-56, 2016 08 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27135262