Detalles de la búsqueda
1.
Quantification of Adaptive Immune Responses Against Protein-Binding Interfaces in the Streptococcal M1 Protein.
Mol Cell Proteomics
; 23(5): 100753, 2024 Mar 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38527648
2.
Multimodal Mass Spectrometry Identifies a Conserved Protective Epitope in S. pyogenes Streptolysin O.
Anal Chem
; 2024 May 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38701337
3.
Multienzyme deep learning models improve peptide de novo sequencing by mass spectrometry proteomics.
PLoS Comput Biol
; 19(1): e1010457, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36668672
4.
Cheetah-MS: a web server to model protein complexes using tandem cross-linking mass spectrometry data.
Bioinformatics
; 37(24): 4871-4872, 2021 12 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34128979
5.
Structural determination of Streptococcus pyogenes M1 protein interactions with human immunoglobulin G using integrative structural biology.
PLoS Comput Biol
; 17(1): e1008169, 2021 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33411763
6.
Proteogenomic Workflow Reveals Molecular Phenotypes Related to Breast Cancer Mammographic Appearance.
J Proteome Res
; 20(5): 2983-3001, 2021 05 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33855848
7.
An objective comparison of cell-tracking algorithms.
Nat Methods
; 14(12): 1141-1152, 2017 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29083403
8.
Structural proteomics, electron cryo-microscopy and structural modeling approaches in bacteria-human protein interactions.
Med Microbiol Immunol
; 209(3): 265-275, 2020 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32072248
9.
Comprehensive ADP-ribosylome analysis identifies tyrosine as an ADP-ribose acceptor site.
EMBO Rep
; 19(8)2018 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29954836
10.
Greedy de novo motif discovery to construct motif repositories for bacterial proteomes.
BMC Bioinformatics
; 20(Suppl 4): 141, 2019 Apr 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30999854
11.
TRIC: an automated alignment strategy for reproducible protein quantification in targeted proteomics.
Nat Methods
; 13(9): 777-83, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27479329
12.
OpenMS: a flexible open-source software platform for mass spectrometry data analysis.
Nat Methods
; 13(9): 741-8, 2016 08 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27575624
13.
Targeted Proteomics and Absolute Protein Quantification for the Construction of a Stoichiometric Host-Pathogen Surface Density Model.
Mol Cell Proteomics
; 16(4 suppl 1): S29-S41, 2017 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28183813
14.
FAIRDOMHub: a repository and collaboration environment for sharing systems biology research.
Nucleic Acids Res
; 45(D1): D404-D407, 2017 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27899646
15.
xTract: software for characterizing conformational changes of protein complexes by quantitative cross-linking mass spectrometry.
Nat Methods
; 12(12): 1185-90, 2015 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26501516
16.
Identification of a Set of Conserved Eukaryotic Internal Retention Time Standards for Data-independent Acquisition Mass Spectrometry.
Mol Cell Proteomics
; 14(10): 2800-13, 2015 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26199342
17.
Efficient visualization of high-throughput targeted proteomics experiments: TAPIR.
Bioinformatics
; 31(14): 2415-7, 2015 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25788625
18.
DIANA--algorithmic improvements for analysis of data-independent acquisition MS data.
Bioinformatics
; 31(4): 555-62, 2015 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25348213
19.
Numerical compression schemes for proteomics mass spectrometry data.
Mol Cell Proteomics
; 13(6): 1537-42, 2014 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24677029
20.
A Combined Shotgun and Targeted Mass Spectrometry Strategy for Breast Cancer Biomarker Discovery.
J Proteome Res
; 14(7): 2807-18, 2015 Jul 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25944384