Detalles de la búsqueda
1.
Sequence-specific minimizers via polar sets.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i187-i195, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252928
2.
HARVESTMAN: a framework for hierarchical feature learning and selection from whole genome sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 174, 2021 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33794760
3.
Improved design and analysis of practical minimizers.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i119-i127, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657376
4.
Hybrid assembly of the large and highly repetitive genome of Aegilops tauschii, a progenitor of bread wheat, with the MaSuRCA mega-reads algorithm.
Genome Res
; 27(5): 787-792, 2017 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28130360
5.
Locality-sensitive hashing for the edit distance.
Bioinformatics
; 35(14): i127-i135, 2019 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31510667
6.
Asymptotically optimal minimizers schemes.
Bioinformatics
; 34(13): i13-i22, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29949995
7.
MUMmer4: A fast and versatile genome alignment system.
PLoS Comput Biol
; 14(1): e1005944, 2018 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29373581
8.
Improving the performance of minimizers and winnowing schemes.
Bioinformatics
; 33(14): i110-i117, 2017 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28881970
9.
Designing small universal k-mer hitting sets for improved analysis of high-throughput sequencing.
PLoS Comput Biol
; 13(10): e1005777, 2017 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28968408
10.
GAGE: A critical evaluation of genome assemblies and assembly algorithms.
Genome Res
; 22(3): 557-67, 2012 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22147368
11.
The MaSuRCA genome assembler.
Bioinformatics
; 29(21): 2669-77, 2013 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23990416
12.
Density and Conservation Optimization of the Generalized Masked-Minimizer Sketching Scheme.
J Comput Biol
; 31(1): 2-20, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37975802
13.
Multi-platform next-generation sequencing of the domestic turkey (Meleagris gallopavo): genome assembly and analysis.
PLoS Biol
; 8(9)2010 Sep 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20838655
14.
Creating and Using Minimizer Sketches in Computational Genomics.
J Comput Biol
; 30(12): 1251-1276, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37646787
15.
Sketching methods with small window guarantee using minimum decycling sets.
ArXiv
; 2023 Nov 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37986724
16.
Large scale sequence alignment via efficient inference in generative models.
Sci Rep
; 13(1): 7285, 2023 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37142645
17.
A fast, lock-free approach for efficient parallel counting of occurrences of k-mers.
Bioinformatics
; 27(6): 764-70, 2011 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21217122
18.
Lower Density Selection Schemes via Small Universal Hitting Sets with Short Remaining Path Length.
J Comput Biol
; 28(4): 395-409, 2021 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33325773
19.
Sequence of the Sugar Pine Megagenome.
Genetics
; 204(4): 1613-1626, 2016 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27794028
20.
QuorUM: An Error Corrector for Illumina Reads.
PLoS One
; 10(6): e0130821, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26083032