Detalles de la búsqueda
1.
Galaxy Training: A powerful framework for teaching!
PLoS Comput Biol
; 19(1): e1010752, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36622853
2.
Metaproteomic Analysis of Nasopharyngeal Swab Samples to Identify Microbial Peptides in COVID-19 Patients.
J Proteome Res
; 22(8): 2608-2619, 2023 08 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37450889
3.
A Galaxy of informatics resources for MS-based proteomics.
Expert Rev Proteomics
; 20(11): 251-266, 2023.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37787106
4.
An optimized workflow for MS-based quantitative proteomics of challenging clinical bronchoalveolar lavage fluid (BALF) samples.
Clin Proteomics
; 20(1): 14, 2023 Apr 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37005570
5.
Metaproteomics Analysis of SARS-CoV-2-Infected Patient Samples Reveals Presence of Potential Coinfecting Microorganisms.
J Proteome Res
; 20(2): 1451-1454, 2021 02 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33393790
6.
Updates on metaQuantome Software for Quantitative Metaproteomics.
J Proteome Res
; 20(4): 2130-2137, 2021 04 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33683127
7.
A rigorous evaluation of optimal peptide targets for MS-based clinical diagnostics of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19).
Clin Proteomics
; 18(1): 15, 2021 May 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33971807
8.
metaQuantome: An Integrated, Quantitative Metaproteomics Approach Reveals Connections Between Taxonomy and Protein Function in Complex Microbiomes.
Mol Cell Proteomics
; 18(8 suppl 1): S82-S91, 2019 08 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31235611
9.
A Sectioning and Database Enrichment Approach for Improved Peptide Spectrum Matching in Large, Genome-Guided Protein Sequence Databases.
J Proteome Res
; 19(7): 2772-2785, 2020 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32396365
10.
Challenges in Peptide-Spectrum Matching: A Robust and Reproducible Statistical Framework for Removing Low-Accuracy, High-Scoring Hits.
J Proteome Res
; 19(1): 161-173, 2020 01 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31793300
11.
Update on the moFF Algorithm for Label-Free Quantitative Proteomics.
J Proteome Res
; 18(2): 728-731, 2019 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30511867
12.
QuanTP: A Software Resource for Quantitative Proteo-Transcriptomic Comparative Data Analysis and Informatics.
J Proteome Res
; 18(2): 782-790, 2019 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30582332
13.
Bridging the Chromosome-centric and Biology/Disease-driven Human Proteome Projects: Accessible and Automated Tools for Interpreting the Biological and Pathological Impact of Protein Sequence Variants Detected via Proteogenomics.
J Proteome Res
; 17(12): 4329-4336, 2018 12 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30130115
14.
A novel clinical metaproteomics workflow enables bioinformatic analysis of host-microbe dynamics in disease.
mSphere
; : e0079323, 2024 May 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38780289
15.
Novel Approach to Exploring Protease Activity and Targets in HIV-associated Obstructive Lung Disease using Combined Proteomic-Peptidomic Analysis.
Res Sq
; 2024 Jun 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38883770
16.
A novel clinical metaproteomics workflow enables bioinformatic analysis of host-microbe dynamics in disease.
bioRxiv
; 2023 Dec 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38045370
17.
Integrative meta-omics in Galaxy and beyond.
Environ Microbiome
; 18(1): 56, 2023 Jul 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37420292
18.
Quantitative Proteogenomic Characterization of Inflamed Murine Colon Tissue Using an Integrated Discovery, Verification, and Validation Proteogenomic Workflow.
Proteomes
; 10(2)2022 Apr 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35466239
19.
Catching the Wave: Detecting Strain-Specific SARS-CoV-2 Peptides in Clinical Samples Collected during Infection Waves from Diverse Geographical Locations.
Viruses
; 14(10)2022 10 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36298760
20.
Gut microbial ß-glucuronidases regulate host luminal proteases and are depleted in irritable bowel syndrome.
Nat Microbiol
; 7(5): 680-694, 2022 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35484230