Detalles de la búsqueda
1.
In Search of Lost Small Peptides.
Annu Rev Cell Dev Biol
; 33: 391-416, 2017 10 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28759257
2.
Explainability in transformer models for functional genomics.
Brief Bioinform
; 22(5)2021 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33834200
3.
CpG Transformer for imputation of single-cell methylomes.
Bioinformatics
; 38(3): 597-603, 2022 01 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34718418
4.
Spectral Prediction Features as a Solution for the Search Space Size Problem in Proteogenomics.
Mol Cell Proteomics
; 20: 100076, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33823297
5.
Discovery of noncanonical translation initiation sites through mass spectrometric analysis of protein N termini.
Genome Res
; 28(1): 25-36, 2018 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29162641
6.
The hunt for sORFs: A multidisciplinary strategy.
Exp Cell Res
; 391(1): 111923, 2020 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32135166
7.
PROTEOFORMER 2.0: Further Developments in the Ribosome Profiling-assisted Proteogenomic Hunt for New Proteoforms.
Mol Cell Proteomics
; 18(8 suppl 1): S126-S140, 2019 08 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31040227
8.
DeepRibo: a neural network for precise gene annotation of prokaryotes by combining ribosome profiling signal and binding site patterns.
Nucleic Acids Res
; 47(6): e36, 2019 04 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30753697
9.
An update on sORFs.org: a repository of small ORFs identified by ribosome profiling.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D497-D502, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29140531
10.
Proteomics Standards Initiative Extended FASTA Format.
J Proteome Res
; 18(6): 2686-2692, 2019 06 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31081335
11.
Mass spectrometric evidence for neuropeptide-amidating enzymes in Caenorhabditis elegans.
J Biol Chem
; 293(16): 6052-6063, 2018 04 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29487130
12.
REPARATION: ribosome profiling assisted (re-)annotation of bacterial genomes.
Nucleic Acids Res
; 45(20): e168, 2017 Nov 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28977509
13.
eIF1 modulates the recognition of suboptimal translation initiation sites and steers gene expression via uORFs.
Nucleic Acids Res
; 45(13): 7997-8013, 2017 Jul 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28541577
14.
Comprehensive Peptide Analysis of Mouse Brain Striatum Identifies Novel sORF-Encoded Polypeptides.
Proteomics
; 18(10): e1700218, 2018 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29710410
15.
A Gene Family Coding for Salivary Proteins (SHOT) of the Polyphagous Spider Mite Tetranychus urticae Exhibits Fast Host-Dependent Transcriptional Plasticity.
Mol Plant Microbe Interact
; 31(1): 112-124, 2018 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29094648
16.
Proteogenomics from a bioinformatics angle: A growing field.
Mass Spectrom Rev
; 36(5): 584-599, 2017 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26670565
17.
A Role for Human N-alpha Acetyltransferase 30 (Naa30) in Maintaining Mitochondrial Integrity.
Mol Cell Proteomics
; 15(11): 3361-3372, 2016 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27694331
18.
The Salivary Protein Repertoire of the Polyphagous Spider Mite Tetranychus urticae: A Quest for Effectors.
Mol Cell Proteomics
; 15(12): 3594-3613, 2016 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27703040
19.
sORFs.org: a repository of small ORFs identified by ribosome profiling.
Nucleic Acids Res
; 44(D1): D324-9, 2016 Jan 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26527729
20.
proBAMconvert: A Conversion Tool for proBAM/proBed.
J Proteome Res
; 16(7): 2639-2644, 2017 07 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28573858