Detalles de la búsqueda
1.
Tissue-specific regulation of gene expression via unproductive splicing.
Nucleic Acids Res
; 51(7): 3055-3066, 2023 04 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36912101
2.
Foreign RNA spike-ins enable accurate allele-specific expression analysis at scale.
Bioinformatics
; 39(39 Suppl 1): i431-i439, 2023 06 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37387154
3.
OrthoQuantum: visualizing evolutionary repertoire of eukaryotic proteins.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W534-W540, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35610035
4.
Studying RNA-DNA interactome by Red-C identifies noncoding RNAs associated with various chromatin types and reveals transcription dynamics.
Nucleic Acids Res
; 48(12): 6699-6714, 2020 07 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32479626
5.
Coloc-stats: a unified web interface to perform colocalization analysis of genomic features.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W186-W193, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29873782
6.
Application of sorting and next generation sequencing to study 5Î-UTR influence on translation efficiency in Escherichia coli.
Nucleic Acids Res
; 45(6): 3487-3502, 2017 04 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27899632
7.
StereoGene: rapid estimation of genome-wide correlation of continuous or interval feature data.
Bioinformatics
; 33(20): 3158-3165, 2017 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29028265
8.
Probing-directed identification of novel structured RNAs.
RNA Biol
; 13(2): 232-42, 2016.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26732206
9.
RNASurface: fast and accurate detection of locally optimal potentially structured RNA segments.
Bioinformatics
; 30(4): 457-63, 2014 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24292360
10.
CORECLUST: identification of the conserved CRM grammar together with prediction of gene regulation.
Nucleic Acids Res
; 40(12): e93, 2012 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22422836
11.
BaRDIC: robust peak calling for RNA-DNA interaction data.
NAR Genom Bioinform
; 6(2): lqae054, 2024 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38774512
12.
Exploring massive, genome scale datasets with the GenometriCorr package.
PLoS Comput Biol
; 8(5): e1002529, 2012 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22693437
13.
Foreign RNA spike-ins enable accurate allele-specific expression analysis at scale.
bioRxiv
; 2023 Feb 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36798258
14.
RegPredict: an integrated system for regulon inference in prokaryotes by comparative genomics approach.
Nucleic Acids Res
; 38(Web Server issue): W299-307, 2010 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20542910
15.
Investigation of the Role of PUFA Metabolism in Breast Cancer Using a Rank-Based Random Forest Algorithm.
Cancers (Basel)
; 14(19)2022 Sep 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36230586
16.
Ectopic expression of HIV-1 Tat modifies gene expression in cultured B cells: implications for the development of B-cell lymphomas in HIV-1-infected patients.
PeerJ
; 10: e13986, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36275462
17.
Evolution of prokaryotic genes by shift of stop codons.
J Mol Evol
; 72(2): 138-46, 2011 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21082168
18.
Replicate sequencing libraries are important for quantification of allelic imbalance.
Nat Commun
; 12(1): 3370, 2021 06 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34099647
19.
Cumulative contact frequency of a chromatin region is an intrinsic property linked to its function.
PeerJ
; 8: e9566, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32864204
20.
Origin of the nuclear proteome on the basis of pre-existing nuclear localization signals in prokaryotic proteins.
Biol Direct
; 15(1): 9, 2020 04 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32345340