Detalles de la búsqueda
1.
AdenPredictor: accurate prediction of the adenylation domain specificity of nonribosomal peptide biosynthetic gene clusters in microbial genomes.
Bioinformatics
; 39(39 Suppl 1): i40-i46, 2023 06 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37387149
2.
Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment.
Nat Methods
; 17(9): 905-908, 2020 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32839597
3.
BiosyntheticSPAdes: reconstructing biosynthetic gene clusters from assembly graphs.
Genome Res
; 29(8): 1352-1362, 2019 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31160374
4.
MS2Planner: improved fragmentation spectra coverage in untargeted mass spectrometry by iterative optimized data acquisition.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i231-i236, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252948
5.
Linking genomics and metabolomics to chart specialized metabolic diversity.
Chem Soc Rev
; 49(11): 3297-3314, 2020 Jun 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32393943
6.
Dereplication of peptidic natural products through database search of mass spectra.
Nat Chem Biol
; 13(1): 30-37, 2017 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27820803
7.
Dereplication, sequencing and identification of peptidic natural products: from genome mining to peptidogenomics to spectral networks.
Nat Prod Rep
; 33(1): 73-86, 2016 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26497201
8.
NRPquest: Coupling Mass Spectrometry and Genome Mining for Nonribosomal Peptide Discovery.
J Nat Prod
; 77(8): 1902-9, 2014 Aug 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25116163
9.
Fast mass spectrometry search and clustering of untargeted metabolomics data.
Nat Biotechnol
; 2024 Jan 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38168990
10.
A new approach to evaluating statistical significance of spectral identifications.
J Proteome Res
; 12(4): 1560-8, 2013 Apr 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23343606
11.
Large scale sequence alignment via efficient inference in generative models.
Sci Rep
; 13(1): 7285, 2023 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37142645
12.
HypoRiPPAtlas as an Atlas of hypothetical natural products for mass spectrometry database search.
Nat Commun
; 14(1): 4219, 2023 07 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37452020
13.
An interpretable machine learning approach to identify mechanism of action of antibiotics.
Sci Rep
; 12(1): 10342, 2022 06 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35725893
14.
TransDiscovery: Discovering Biotransformation from Human Microbiota by Integrating Metagenomic and Metabolomic Data.
Metabolites
; 12(2)2022 Jan 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35208194
15.
Sequencing cyclic peptides by multistage mass spectrometry.
Proteomics
; 11(18): 3642-50, 2011 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21751357
16.
Cycloquest: identification of cyclopeptides via database search of their mass spectra against genome databases.
J Proteome Res
; 10(10): 4505-12, 2011 Oct 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21851130
17.
Cytotoxic veraguamides, alkynyl bromide-containing cyclic depsipeptides from the marine cyanobacterium cf. Oscillatoria margaritifera.
J Nat Prod
; 74(5): 928-36, 2011 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21488639
18.
Repository scale classification and decomposition of tandem mass spectral data.
Sci Rep
; 11(1): 8314, 2021 04 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33859284
19.
MolDiscovery: learning mass spectrometry fragmentation of small molecules.
Nat Commun
; 12(1): 3718, 2021 06 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34140479
20.
Nerpa: A Tool for Discovering Biosynthetic Gene Clusters of Bacterial Nonribosomal Peptides.
Metabolites
; 11(10)2021 Oct 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34677408