Detalles de la búsqueda
1.
Cell shape and negative links in regulatory motifs together control spatial information flow in signaling networks.
Cell
; 133(4): 666-80, 2008 May 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18485874
2.
RunBioSimulations: an extensible web application that simulates a wide range of computational modeling frameworks, algorithms, and formats.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W597-W602, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34019658
3.
SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models.
Mol Syst Biol
; 16(8): e9110, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32845085
4.
Compartmental and Spatial Rule-Based Modeling with Virtual Cell.
Biophys J
; 113(7): 1365-1372, 2017 Oct 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28978431
5.
NMRbox: A Resource for Biomolecular NMR Computation.
Biophys J
; 112(8): 1529-1534, 2017 Apr 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28445744
6.
Rule-based modeling with Virtual Cell.
Bioinformatics
; 32(18): 2880-2, 2016 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27497444
7.
Pathway Commons at virtual cell: use of pathway data for mathematical modeling.
Bioinformatics
; 30(2): 292-4, 2014 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24273241
8.
Logic modeling and the ridiculome under the rug.
BMC Biol
; 10: 92, 2012 Nov 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23171629
9.
Dynamic model assuming mutually inhibitory biomarkers of frailty suggests bistability with contrasting mobility phenotypes.
Front Netw Physiol
; 3: 1079070, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37216041
10.
Leveraging modeling approaches: reaction networks and rules.
Adv Exp Med Biol
; 736: 517-30, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22161349
11.
Virtual NEURON: a strategy for merged biochemical and electrophysiological modeling.
J Comput Neurosci
; 31(2): 385-400, 2011 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21340454
12.
Simulation Experiment Description Markup Language (SED-ML) Level 1 Version 3 (L1V3).
J Integr Bioinform
; 15(1)2018 Mar 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29550789
13.
Correction to: Meeting report from the fourth meeting of the Computational Modeling in Biology Network (COMBINE).
Stand Genomic Sci
; 13: 17, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30117501
14.
Minimum Information About a Simulation Experiment (MIASE).
PLoS Comput Biol
; 7(4): e1001122, 2011 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21552546
15.
Phosphorylation state-dependent interaction between AKAP7δ/γ and phospholamban increases phospholamban phosphorylation.
Cell Signal
; 27(9): 1807-15, 2015 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26027516
16.
SBML Level 3 package: Hierarchical Model Composition, Version 1 Release 3.
J Integr Bioinform
; 12(2): 268, 2015 Sep 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26528566
17.
Analysis of AKAP7γ Dimerization.
J Signal Transduct
; 2015: 371626, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26417456
18.
Computed tomography number changes observed during computed tomography-guided radiation therapy for head and neck cancer.
Int J Radiat Oncol Biol Phys
; 91(5): 1041-7, 2015 Apr 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25832695
19.
A wave of IP3 production accompanies the fertilization Ca2+ wave in the egg of the frog, Xenopus laevis: theoretical and experimental support.
Cell Calcium
; 35(5): 433-47, 2004 May.
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| MEDLINE | ID: mdl-15003853
20.
Radiation dose responses for chemoradiation therapy of pancreatic cancer: an analysis of compiled clinical data using biophysical models.
Pract Radiat Oncol
; 4(1): 13-9, 2014.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24621418