Detalles de la búsqueda
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MCMICRO: a scalable, modular image-processing pipeline for multiplexed tissue imaging.
Nat Methods
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Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34824477
2.
Mechanistic model of MAPK signaling reveals how allostery and rewiring contribute to drug resistance.
Mol Syst Biol
; 19(2): e10988, 2023 02 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36700386
3.
Stitching and registering highly multiplexed whole-slide images of tissues and tumors using ASHLAR.
Bioinformatics
; 38(19): 4613-4621, 2022 09 30.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35972352
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piNET: a versatile web platform for downstream analysis and visualization of proteomics data.
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| MEDLINE | ID: mdl-32469073
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MITI minimum information guidelines for highly multiplexed tissue images.
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| MEDLINE | ID: mdl-35277708
6.
From word models to executable models of signaling networks using automated assembly.
Mol Syst Biol
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| MEDLINE | ID: mdl-29175850
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GRcalculator: an online tool for calculating and mining dose-response data.
BMC Cancer
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| MEDLINE | ID: mdl-29065900
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A Quantitative Approach to Screen for Nephrotoxic Compounds In Vitro.
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| MEDLINE | ID: mdl-26260164
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LINCS Canvas Browser: interactive web app to query, browse and interrogate LINCS L1000 gene expression signatures.
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| MEDLINE | ID: mdl-24906883
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Analysis of growth factor signaling in genetically diverse breast cancer lines.
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| MEDLINE | ID: mdl-24655548
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Adaptive informatics for multifactorial and high-content biological data.
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| MEDLINE | ID: mdl-21516115
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Programming biological models in Python using PySB.
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| MEDLINE | ID: mdl-23423320
13.
Properties of cell death models calibrated and compared using Bayesian approaches.
Mol Syst Biol
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Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23385484
14.
Quality Control for Single Cell Analysis of High-plex Tissue Profiles using CyLinter.
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| MEDLINE | ID: mdl-37961235
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Visinity: Visual Spatial Neighborhood Analysis for Multiplexed Tissue Imaging Data.
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| MEDLINE | ID: mdl-36170403
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Addressing persistent challenges in digital image analysis of cancerous tissues.
bioRxiv
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| MEDLINE | ID: mdl-37547011
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Scope2Screen: Focus+Context Techniques for Pathology Tumor Assessment in Multivariate Image Data.
IEEE Trans Vis Comput Graph
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| MEDLINE | ID: mdl-34606456
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Narrative online guides for the interpretation of digital-pathology images and tissue-atlas data.
Nat Biomed Eng
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| MEDLINE | ID: mdl-34750536
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shinyDepMap, a tool to identify targetable cancer genes and their functional connections from Cancer Dependency Map data.
Elife
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| MEDLINE | ID: mdl-33554860
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A Simple Method for Creating a High-Content Microscope for Imaging Multiplexed Tissue Microarrays.
Curr Protoc
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Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33822482