Detalles de la búsqueda
1.
Adaptive sampling for nanopore direct RNA-sequencing.
RNA
; 29(12): 1939-1949, 2023 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37673469
2.
Characterizing alternative splicing effects on protein interaction networks with LINDA.
Bioinformatics
; 39(39 Suppl 1): i458-i464, 2023 06 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37387163
3.
A comparison of metabolic labeling and statistical methods to infer genome-wide dynamics of RNA turnover.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34228787
4.
Comprehensive identification of diverse ribosomal RNA modifications by targeted nanopore direct RNA sequencing and JACUSA2.
RNA Biol
; 20(1): 652-665, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37635368
5.
Methylated HNRNPK acts on RPS19 to regulate ALOX15 synthesis in erythropoiesis.
Nucleic Acids Res
; 49(6): 3507-3523, 2021 04 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33660773
6.
Improved nanopore direct RNA sequencing of cardiac myocyte samples by selective mt-RNA depletion.
J Mol Cell Cardiol
; 163: 175-186, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34742715
7.
Nanopore Detection of METTL3-Dependent m6A-Modified mRNA Reveals a New Mechanism Regulating Cardiomyocyte Mitochondrial Metabolism.
Circulation
; 149(16): 1319-1322, 2024 Apr 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38620081
8.
On the optimal design of metabolic RNA labeling experiments.
PLoS Comput Biol
; 15(8): e1007252, 2019 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31390362
9.
Translational control mediated by hnRNP K links NMHC IIA to erythroid enucleation.
J Cell Sci
; 129(6): 1141-54, 2016 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26823606
10.
Identification of RNA-binding Proteins in Macrophages by Interactome Capture.
Mol Cell Proteomics
; 15(8): 2699-714, 2016 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27281784
11.
Hypoxia-induced gene expression results from selective mRNA partitioning to the endoplasmic reticulum.
Nucleic Acids Res
; 43(6): 3219-36, 2015 Mar 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25753659
12.
Identification of DEAD-box RNA helicase 6 (DDX6) as a cellular modulator of vascular endothelial growth factor expression under hypoxia.
J Biol Chem
; 288(8): 5815-27, 2013 Feb 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23293030
13.
Biophysical and biochemical analysis of hnRNP K: arginine methylation, reversible aggregation and combinatorial binding to nucleic acids.
Biol Chem
; 395(7-8): 837-53, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25003387
14.
Detecting m6A at single-molecular resolution via direct RNA sequencing and realistic training data.
Nat Commun
; 15(1): 3323, 2024 Apr 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38637518
15.
Insight into the mechanism of AML del(9q) progression: hnRNP K targets the myeloid master regulators CEBPA (C/EBPα) and SPI1 (PU.1).
Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech
; 1867(1): 195004, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38008244
16.
Mapping of RNA Modifications by Direct Nanopore Sequencing and JACUSA2.
Methods Mol Biol
; 2624: 241-260, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36723820
17.
RNA modification mapping with JACUSA2.
Genome Biol
; 23(1): 115, 2022 05 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35578346
18.
Targeted Analysis of circRNA Expression in Patient Samples by Lexo-circSeq.
Front Mol Biosci
; 9: 875805, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35755822
19.
Full-Length Spatial Transcriptomics Reveals the Unexplored Isoform Diversity of the Myocardium Post-MI.
Front Genet
; 13: 912572, 2022.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35937994
20.
P23 Acts as Functional RBP in the Macrophage Inflammation Response.
Front Mol Biosci
; 8: 625608, 2021.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34179071