Detalles de la búsqueda
1.
Ebola virus VP35 interacts non-covalently with ubiquitin chains to promote viral replication.
PLoS Biol
; 22(2): e3002544, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38422166
2.
The DynaSig-ML Python package: automated learning of biomolecular dynamics-function relationships.
Bioinformatics
; 39(4)2023 04 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37079725
3.
Surfaces: a software to quantify and visualize interactions within and between proteins and ligands.
Bioinformatics
; 39(10)2023 10 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37788107
4.
SPEAR: Systematic ProtEin AnnotatoR.
Bioinformatics
; 38(15): 3827-3829, 2022 08 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35695776
5.
Sequence-sensitive elastic network captures dynamical features necessary for miR-125a maturation.
PLoS Comput Biol
; 18(12): e1010777, 2022 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36516216
6.
The NRGTEN Python package: an extensible toolkit for coarse-grained normal mode analysis of proteins, nucleic acids, small molecules and their complexes.
Bioinformatics
; 37(19): 3369-3371, 2021 Oct 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33742655
7.
Modelling conformational state dynamics and its role on infection for SARS-CoV-2 Spike protein variants.
PLoS Comput Biol
; 17(8): e1009286, 2021 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34351895
8.
A three-way inter-molecular network accounts for the CaVα2δ1-induced functional modulation of the pore-forming CaV1.2 subunit.
J Biol Chem
; 293(19): 7176-7188, 2018 05 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29588365
9.
IsoMIF Finder: online detection of binding site molecular interaction field similarities.
Bioinformatics
; 32(4): 621-3, 2016 Feb 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26504139
10.
ENCoM server: exploring protein conformational space and the effect of mutations on protein function and stability.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W395-400, 2015 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25883149
11.
NRGsuite: a PyMOL plugin to perform docking simulations in real time using FlexAID.
Bioinformatics
; 31(23): 3856-8, 2015 Dec 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26249810
12.
Achievements and challenges in structural bioinformatics and computational biophysics.
Bioinformatics
; 31(1): 146-50, 2015 Jan 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25488929
13.
A coarse-grained elastic network atom contact model and its use in the simulation of protein dynamics and the prediction of the effect of mutations.
PLoS Comput Biol
; 10(4): e1003569, 2014 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24762569
14.
Detection of Binding Site Molecular Interaction Field Similarities.
J Chem Inf Model
; 55(8): 1600-15, 2015 Aug 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26158641
15.
FlexAID: Revisiting Docking on Non-Native-Complex Structures.
J Chem Inf Model
; 55(7): 1323-36, 2015 Jul 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26076070
16.
Side-chain rotamer changes upon ligand binding: common, crucial, correlate with entropy and rearrange hydrogen bonding.
Bioinformatics
; 28(18): i423-i430, 2012 Sep 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22962462
17.
Large-scale analysis of conserved rare codon clusters suggests an involvement in co-translational molecular recognition events.
Bioinformatics
; 28(11): 1438-45, 2012 Jun 01.
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| MEDLINE | ID: mdl-22467916
18.
Ebola Virus VP35 Interacts Non-Covalently with Ubiquitin Chains to Promote Viral Replication Creating New Therapeutic Opportunities.
bioRxiv
; 2023 Jul 15.
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| MEDLINE | ID: mdl-37503276
19.
StAR-related lipid transfer domain protein 5 binds primary bile acids.
J Lipid Res
; 53(12): 2677-89, 2012 Dec.
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| MEDLINE | ID: mdl-23018617
20.
Selective CDK9 Inhibition by Natural Compound Toyocamycin in Cancer Cells.
Cancers (Basel)
; 14(14)2022 Jul 08.
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| MEDLINE | ID: mdl-35884401