Detalles de la búsqueda
1.
A universal framework for detecting cis-regulatory diversity in DNA regions.
Genome Res
; 31(9): 1646-1662, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34285090
2.
Orc4 spatiotemporally stabilizes centromeric chromatin.
Genome Res
; 31(4): 607-621, 2021 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33514624
3.
Resolving diverse protein-DNA footprints from exonuclease-based ChIP experiments.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i367-i375, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252930
4.
Genome-wide analyses of transcription factor GATA3-mediated gene regulation in distinct T cell types.
Immunity
; 35(2): 299-311, 2011 Aug 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21867929
5.
THiCweed: fast, sensitive detection of sequence features by clustering big datasets.
Nucleic Acids Res
; 46(5): e29, 2018 03 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29267972
6.
DIVERSITY in binding, regulation, and evolution revealed from high-throughput ChIP.
PLoS Comput Biol
; 14(4): e1006090, 2018 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29684008
7.
No Promoter Left Behind (NPLB): learn de novo promoter architectures from genome-wide transcription start sites.
Bioinformatics
; 32(5): 779-81, 2016 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26530723
8.
Multiple novel promoter-architectures revealed by decoding the hidden heterogeneity within the genome.
Nucleic Acids Res
; 42(20): 12388-403, 2014 Nov 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25326324
9.
MuMoD: a Bayesian approach to detect multiple modes of protein-DNA binding from genome-wide ChIP data.
Nucleic Acids Res
; 41(1): 21-32, 2013 Jan 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23093591
10.
One size does not fit all: on how Markov model order dictates performance of genomic sequence analyses.
Nucleic Acids Res
; 41(3): 1416-24, 2013 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23267010
11.
Ensemble Learning for Higher Diagnostic Precision in Schizophrenia Using Peripheral Blood Gene Expression Profile.
Neuropsychiatr Dis Treat
; 20: 923-936, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38716091
12.
Genome-wide discovery of human heart enhancers.
Genome Res
; 20(3): 381-92, 2010 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20075146
13.
CLARE: Cracking the LAnguage of Regulatory Elements.
Bioinformatics
; 28(4): 581-3, 2012 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22199387
14.
Transcription factors organize into functional groups on the linear genome and in 3D chromatin.
Heliyon
; 9(8): e18211, 2023 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37520992
15.
Prediction of postpartum prediabetes by machine learning methods in women with gestational diabetes mellitus.
iScience
; 26(10): 107846, 2023 Oct 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37767000
16.
Finding regulatory DNA motifs using alignment-free evolutionary conservation information.
Nucleic Acids Res
; 38(6): e90, 2010 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20047961
17.
Machine learning prediction of non-attendance to postpartum glucose screening and subsequent risk of type 2 diabetes following gestational diabetes.
PLoS One
; 17(3): e0264648, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35255105
18.
Identifying regulatory elements in eukaryotic genomes.
Brief Funct Genomic Proteomic
; 8(4): 215-30, 2009 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19498043
19.
A nucleosome-guided map of transcription factor binding sites in yeast.
PLoS Comput Biol
; 3(11): e215, 2007 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-17997593
20.
Informative priors based on transcription factor structural class improve de novo motif discovery.
Bioinformatics
; 22(14): e384-92, 2006 Jul 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16873497