Detalles de la búsqueda
1.
Discovery of Reactive Microbiota-Derived Metabolites that Inhibit Host Proteases.
Cell
; 168(3): 517-526.e18, 2017 01 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28111075
2.
Toward Accurate and Quantitative Comparative Metagenomics.
Cell
; 166(5): 1103-1116, 2016 Aug 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27565341
3.
Unraveling the functional dark matter through global metagenomics.
Nature
; 622(7983): 594-602, 2023 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37821698
4.
iPHoP: An integrated machine learning framework to maximize host prediction for metagenome-derived viruses of archaea and bacteria.
PLoS Biol
; 21(4): e3002083, 2023 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37083735
5.
IMG/PR: a database of plasmids from genomes and metagenomes with rich annotations and metadata.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D164-D173, 2024 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37930866
6.
New insights from uncultivated genomes of the global human gut microbiome.
Nature
; 568(7753): 505-510, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30867587
7.
IMG/VR v4: an expanded database of uncultivated virus genomes within a framework of extensive functional, taxonomic, and ecological metadata.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D733-D743, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36399502
8.
MIDAS2: Metagenomic Intra-species Diversity Analysis System.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36321886
9.
IMG/VR v3: an integrated ecological and evolutionary framework for interrogating genomes of uncultivated viruses.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D764-D775, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33137183
10.
An integrated metagenomics pipeline for strain profiling reveals novel patterns of bacterial transmission and biogeography.
Genome Res
; 26(11): 1612-1625, 2016 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27803195
11.
Phylogeny-corrected identification of microbial gene families relevant to human gut colonization.
PLoS Comput Biol
; 14(8): e1006242, 2018 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30091981
12.
MetaQuery: a web server for rapid annotation and quantitative analysis of specific genes in the human gut microbiome.
Bioinformatics
; 31(20): 3368-70, 2015 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26104745
13.
Automated and Accurate Estimation of Gene Family Abundance from Shotgun Metagenomes.
PLoS Comput Biol
; 11(11): e1004573, 2015 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26565399
14.
Identifying species-specific k-mers for fast and accurate metagenotyping with Maast and GT-Pro.
STAR Protoc
; 4(1): 101964, 2023 03 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36856771
15.
Maast: genotyping thousands of microbial strains efficiently.
Genome Biol
; 24(1): 186, 2023 08 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37563669
16.
Identification of mobile genetic elements with geNomad.
Nat Biotechnol
; 2023 Sep 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37735266
17.
Fast and accurate metagenotyping of the human gut microbiome with GT-Pro.
Nat Biotechnol
; 40(4): 507-516, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34949778
18.
Dissecting the dominant hot spring microbial populations based on community-wide sampling at single-cell genomic resolution.
ISME J
; 16(5): 1337-1347, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34969995
19.
Expanding the genomic encyclopedia of Actinobacteria with 824 isolate reference genomes.
Cell Genom
; 2(12): 100213, 2022 Dec 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36778052
20.
Illuminating the Virosphere Through Global Metagenomics.
Annu Rev Biomed Data Sci
; 4: 369-391, 2021 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34465172