Detalles de la búsqueda
1.
Cloud computing for genomic data analysis and collaboration.
Nat Rev Genet
; 19(5): 325, 2018 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29430012
2.
Cloud computing for genomic data analysis and collaboration.
Nat Rev Genet
; 19(4): 208-219, 2018 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29379135
3.
pepsickle rapidly and accurately predicts proteasomal cleavage sites for improved neoantigen identification.
Bioinformatics
; 37(21): 3723-3733, 2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34478497
4.
Human Leukocyte Antigen Susceptibility Map for Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2.
J Virol
; 94(13)2020 06 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32303592
5.
neoepiscope improves neoepitope prediction with multivariant phasing.
Bioinformatics
; 36(3): 713-720, 2020 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31424527
6.
qSVA framework for RNA quality correction in differential expression analysis.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(27): 7130-7135, 2017 07 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28634288
7.
Snaptron: querying splicing patterns across tens of thousands of RNA-seq samples.
Bioinformatics
; 34(1): 114-116, 2018 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28968689
8.
Flexible expressed region analysis for RNA-seq with derfinder.
Nucleic Acids Res
; 45(2): e9, 2017 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27694310
9.
Rail-RNA: scalable analysis of RNA-seq splicing and coverage.
Bioinformatics
; 33(24): 4033-4040, 2017 Dec 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27592709
10.
Population-level distribution and putative immunogenicity of cancer neoepitopes.
BMC Cancer
; 18(1): 414, 2018 04 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29653567
11.
Rail-dbGaP: analyzing dbGaP-protected data in the cloud with Amazon Elastic MapReduce.
Bioinformatics
; 32(16): 2551-3, 2016 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153614
12.
recountmethylation enables flexible analysis of public blood DNA methylation array data.
Bioinform Adv
; 3(1): vbad020, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36874953
13.
Minimal observed impact of HLA genotype on hospitalization and severity of SARS-CoV-2 infection.
HLA
; 99(6): 607-613, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35118818
14.
Retained introns in long RNA-seq reads are not reliably detected in sample-matched short reads.
Genome Biol
; 23(1): 240, 2022 11 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36369064
15.
Human methylome variation across Infinium 450K data on the Gene Expression Omnibus.
NAR Genom Bioinform
; 3(2): lqab025, 2021 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33937763
16.
recount3: summaries and queries for large-scale RNA-seq expression and splicing.
Genome Biol
; 22(1): 323, 2021 11 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34844637
17.
Putatively cancer-specific exon-exon junctions are shared across patients and present in developmental and other non-cancer cells.
NAR Cancer
; 2(1): zcaa001, 2020 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34316681
18.
Burden of tumor mutations, neoepitopes, and other variants are weak predictors of cancer immunotherapy response and overall survival.
Genome Med
; 12(1): 33, 2020 03 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32228719
19.
Alternative splicing of MR1 regulates antigen presentation to MAIT cells.
Sci Rep
; 10(1): 15429, 2020 09 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32963314
20.
ASCOT identifies key regulators of neuronal subtype-specific splicing.
Nat Commun
; 11(1): 137, 2020 01 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31919425