Detalles de la búsqueda
1.
Calculation of protein-ligand binding entropies using a rule-based molecular fingerprint.
Biophys J
; 2024 Mar 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38481102
2.
Phosphoserine inhibits neighboring arginine methylation in the RKS motif of histone H3.
Arch Biochem Biophys
; 698: 108716, 2021 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33309545
3.
Benchmarking Electronic Structure Methods for Accurate Fixed-Charge Electrostatic Models.
J Chem Inf Model
; 60(1): 249-258, 2020 01 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31805237
4.
Embedding Aß42 in heterogeneous membranes depends on cholesterol asymmetries.
Biophys J
; 105(4): 899-910, 2013 Aug 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23972842
5.
Perturbing the folding energy landscape of the bacterial immunity protein Im7 by site-specific N-linked glycosylation.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(52): 22528-33, 2010 Dec 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21148421
6.
Unraveling Complex Local Protein Environments with 4-Cyano-l-phenylalanine.
J Phys Chem B
; 126(44): 8957-8969, 2022 11 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36317866
7.
Homogeneous and heterogeneous tertiary structure ensembles of amyloid-ß peptides.
Biochemistry
; 50(35): 7612-28, 2011 Sep 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21797254
8.
Development and Validation of AMBER-FB15-Compatible Force Field Parameters for Phosphorylated Amino Acids.
J Phys Chem B
; 125(43): 11927-11942, 2021 11 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34668708
9.
The contribution of interchain salt bridges to triple-helical stability in collagen.
Biophys J
; 98(11): 2634-43, 2010 Jun 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20513408
10.
Cleavage site specificity and conformational selection in type I collagen degradation.
Biochemistry
; 49(19): 4147-58, 2010 May 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20394413
11.
Non-bonded force field model with advanced restrained electrostatic potential charges (RESP2).
Commun Chem
; 32020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34136662
12.
Physical basis of metal-binding specificity in Escherichia coli NikR.
J Am Chem Soc
; 131(29): 10220-8, 2009 Jul 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19621966
13.
Systematic Optimization of Water Models Using Liquid/Vapor Surface Tension Data.
J Phys Chem B
; 123(32): 7061-7073, 2019 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31314516
14.
Do collagenases unwind triple-helical collagen before peptide bond hydrolysis? Reinterpreting experimental observations with mathematical models.
Proteins
; 70(4): 1154-61, 2008 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17932911
15.
New developments in force fields for biomolecular simulations.
Curr Opin Struct Biol
; 49: 129-138, 2018 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29477047
16.
Collagen--a necessary accomplice in the metastatic process.
Cancer Genomics Proteomics
; 4(5): 319-28, 2007.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17993716
17.
Correction to Development and Validation of AMBER-FB15-Compatible Force Field Parameters for Phosphorylated Amino Acids.
J Phys Chem B
; 126(42): 8596, 2022 Oct 27.
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| MEDLINE | ID: mdl-36223551
18.
Disordered structural ensembles of vasopressin and oxytocin and their mutants.
J Phys Chem B
; 119(3): 896-905, 2015 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25231121
19.
Optimizing Protein-Protein van der Waals Interactions for the AMBER ff9x/ff12 Force Field.
J Chem Theory Comput
; 10(1): 273-81, 2014 Jan 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26579910
20.
Optimizing solute-water van der Waals interactions to reproduce solvation free energies.
J Phys Chem B
; 116(15): 4524-34, 2012 Apr 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22443635