Detalles de la búsqueda
1.
Morphology of a Transmembrane Aß42 Tetramer via REMD Simulations.
J Chem Inf Model
; 63(14): 4376-4382, 2023 07 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37409844
2.
Amyloid Oligomers: A Joint Experimental/Computational Perspective on Alzheimer's Disease, Parkinson's Disease, Type II Diabetes, and Amyotrophic Lateral Sclerosis.
Chem Rev
; 121(4): 2545-2647, 2021 02 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33543942
3.
Searching for potential inhibitors of SARS-COV-2 main protease using supervised learning and perturbation calculations.
Chem Phys
; 564: 111709, 2023 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36188488
4.
Improving ligand-ranking of AutoDock Vina by changing the empirical parameters.
J Comput Chem
; 43(3): 160-169, 2022 01 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34716930
5.
Correction: Characterizing the ligand-binding affinity toward SARS-CoV-2 Mpro via physics- and knowledge-based approaches.
Phys Chem Chem Phys
; 25(1): 878, 2022 Dec 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36511167
6.
Characterizing the ligand-binding affinity toward SARS-CoV-2 Mpro via physics- and knowledge-based approaches.
Phys Chem Chem Phys
; 24(48): 29266-29278, 2022 Dec 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36449268
7.
Effect of Cholesterol Molecules on Aß1-42 Wild-Type and Mutants Trimers.
Molecules
; 27(4)2022 Feb 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35209177
8.
Estimating the ligand-binding affinity via λ-dependent umbrella sampling simulations.
J Comput Chem
; 42(2): 117-123, 2021 01 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33078419
9.
Benchmark of Popular Free Energy Approaches Revealing the Inhibitors Binding to SARS-CoV-2 Mpro.
J Chem Inf Model
; 61(5): 2302-2312, 2021 05 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33829781
10.
Substrate selectivity in starch polysaccharide monooxygenases.
J Biol Chem
; 294(32): 12157-12166, 2019 08 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31235519
11.
Oversampling Free Energy Perturbation Simulation in Determination of the Ligand-Binding Free Energy.
J Comput Chem
; 41(7): 611-618, 2020 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31840845
12.
Computational Determination of Potential Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease.
J Chem Inf Model
; 60(12): 5771-5780, 2020 12 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32530282
13.
Autodock Vina Adopts More Accurate Binding Poses but Autodock4 Forms Better Binding Affinity.
J Chem Inf Model
; 60(1): 204-211, 2020 01 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31887035
14.
Impact of the Astaxanthin, Betanin, and EGCG Compounds on Small Oligomers of Amyloid Aß40 Peptide.
J Chem Inf Model
; 60(3): 1399-1408, 2020 03 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32105466
15.
Photofragmentation Patterns of Cobalt Oxide Cations ConOm+ (n = 5-9, m = 4-13): From Oxygen-Deficient to Oxygen-Rich Species.
J Phys Chem A
; 124(37): 7333-7339, 2020 Sep 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32614577
16.
Replica exchange molecular dynamics study of the truncated amyloid beta (11-40) trimer in solution.
Phys Chem Chem Phys
; 19(3): 1909-1919, 2017 Jan 18.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28004051
17.
Fast and accurate determination of the relative binding affinities of small compounds to HIV-1 protease using non-equilibrium work.
J Comput Chem
; 37(31): 2734-2742, 2016 12 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27709639
18.
Anti-arrhythmic Medication Propafenone a Potential Drug for Alzheimer's Disease Inhibiting Aggregation of Aß: In Silico and in Vitro Studies.
J Chem Inf Model
; 56(7): 1344-56, 2016 07 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27304669
19.
In silico and in vitro characterization of anti-amyloidogenic activity of vitamin K3 analogues for Alzheimer's disease.
Biochim Biophys Acta
; 1830(4): 2960-9, 2013 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23295971
20.
Silver nanoparticles alter the dimerization of Aß42 studied by REMD simulations.
RSC Adv
; 14(21): 15112-15119, 2024 May 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38720971