Detalles de la búsqueda
1.
Emu: species-level microbial community profiling of full-length 16S rRNA Oxford Nanopore sequencing data.
Nat Methods
; 19(7): 845-853, 2022 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35773532
2.
Parsnp 2.0: scalable core-genome alignment for massive microbial datasets.
Bioinformatics
; 40(5)2024 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38724243
3.
Bakdrive: identifying a minimum set of bacterial species driving interactions across multiple microbial communities.
Bioinformatics
; 39(39 Suppl 1): i47-i56, 2023 06 30.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37387148
4.
Correction to: The performance of coalescent-based species tree estimation methods under models of missing data.
BMC Genomics
; 21(1): 133, 2020 02 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32039710
5.
Evaluating Statistical Multiple Sequence Alignment in Comparison to Other Alignment Methods on Protein Data Sets.
Syst Biol
; 68(3): 396-411, 2019 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30329135
6.
Long-Branch Attraction in Species Tree Estimation: Inconsistency of Partitioned Likelihood and Topology-Based Summary Methods.
Syst Biol
; 68(2): 281-297, 2019 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30247732
7.
The performance of coalescent-based species tree estimation methods under models of missing data.
BMC Genomics
; 19(Suppl 5): 286, 2018 May 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29745854
8.
Fixation Strength of Polyetheretherketone Sheath-and-Bullet Device for Soft Tissue Repair in the Foot and Ankle.
J Foot Ankle Surg
; 57(1): 60-64, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29268903
9.
Scaling statistical multiple sequence alignment to large datasets.
BMC Genomics
; 17(Suppl 10): 764, 2016 11 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28185555
10.
HIPPI: highly accurate protein family classification with ensembles of HMMs.
BMC Genomics
; 17(Suppl 10): 765, 2016 11 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28185571
11.
Misunderstood parameter of NCBI BLAST impacts the correctness of bioinformatics workflows.
Bioinformatics
; 35(9): 1613-1614, 2019 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30247621
12.
Microbial Community Profiling Protocol with Full-length 16S rRNA Sequences and Emu.
Curr Protoc
; 4(3): e978, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38511467
13.
Parsnp 2.0: Scalable Core-Genome Alignment for Massive Microbial Datasets.
bioRxiv
; 2024 Jan 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38352342
14.
Multiple genome alignment in the telomere-to-telomere assembly era.
Genome Biol
; 23(1): 182, 2022 08 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36038949
15.
KOMB: K-core based de novo characterization of copy number variation in microbiomes.
Comput Struct Biotechnol J
; 20: 3208-3222, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35832621
16.
Alterations to the gut microbiome after sport-related concussion in a collegiate football players cohort: A pilot study.
Brain Behav Immun Health
; 21: 100438, 2022 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35284846
17.
Current progress and open challenges for applying deep learning across the biosciences.
Nat Commun
; 13(1): 1728, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35365602
18.
It takes guts to learn: machine learning techniques for disease detection from the gut microbiome.
Emerg Top Life Sci
; 5(6): 815-827, 2021 12 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34779841
19.
Accelerating SARS-CoV-2 low frequency variant calling on ultra deep sequencing datasets.
ArXiv
; 2021 May 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33972927
20.
Arthrodesis of the first metatarsocuneiform joint: a comparative cadaveric study of external and internal fixation.
J Foot Ankle Surg
; 48(1): 15-21, 2009.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19110155