Detalles de la búsqueda
1.
Harmonizing semantic annotations for computational models in biology.
Brief Bioinform
; 20(2): 540-550, 2019 03 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30462164
2.
SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models.
Mol Syst Biol
; 16(8): e9110, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32845085
3.
Probing the Genome-Scale Metabolic Landscape of Bordetella pertussis, the Causative Agent of Whooping Cough.
Appl Environ Microbiol
; 83(21)2017 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28842544
4.
Interplay between constraints, objectives, and optimality for genome-scale stoichiometric models.
PLoS Comput Biol
; 11(4): e1004166, 2015 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25849486
5.
Using a genome-scale metabolic model of Enterococcus faecalis V583 to assess amino acid uptake and its impact on central metabolism.
Appl Environ Microbiol
; 81(5): 1622-33, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25527553
6.
COMBINE archive and OMEX format: one file to share all information to reproduce a modeling project.
BMC Bioinformatics
; 15: 369, 2014 Dec 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25494900
7.
Inspecting the Solution Space of Genome-Scale Metabolic Models.
Metabolites
; 12(1)2022 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35050165
8.
Protein cost allocation explains metabolic strategies in Escherichia coli.
J Biotechnol
; 327: 54-63, 2021 Feb 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33309962
9.
Enzymes or redox couples? The kinetics of thioredoxin and glutaredoxin reactions in a systems biology context.
Biochem J
; 417(1): 269-75, 2009 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18694397
10.
Publisher Correction: MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing.
Nat Biotechnol
; 38(4): 504, 2020 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32265554
11.
A systematic assessment of current genome-scale metabolic reconstruction tools.
Genome Biol
; 20(1): 158, 2019 08 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31391098
12.
The Systems Biology Markup Language (SBML): Language Specification for Level 3 Version 2 Core Release 2.
J Integr Bioinform
; 16(2)2019 Jun 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31219795
13.
SBML Level 3 Package: Flux Balance Constraints version 2.
J Integr Bioinform
; 15(1)2018 Mar 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29522419
14.
Simulation Experiment Description Markup Language (SED-ML) Level 1 Version 3 (L1V3).
J Integr Bioinform
; 15(1)2018 Mar 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29550789
15.
The Systems Biology Markup Language (SBML): Language Specification for Level 3 Version 2 Core.
J Integr Bioinform
; 15(1)2018 Mar 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29522418
16.
Correction to: Meeting report from the fourth meeting of the Computational Modeling in Biology Network (COMBINE).
Stand Genomic Sci
; 13: 17, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30117501
17.
Model-based quantification of metabolic interactions from dynamic microbial-community data.
PLoS One
; 12(3): e0173183, 2017.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28278266
18.
Towards building the silicon cell: a modular approach.
Biosystems
; 83(2-3): 207-16, 2006.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16242236
19.
Modeling and Simulation Tools: From Systems Biology to Systems Medicine.
Methods Mol Biol
; 1386: 441-63, 2016.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26677194
20.
Constraint-based stoichiometric modelling from single organisms to microbial communities.
J R Soc Interface
; 13(124)2016 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28334697