Detalles de la búsqueda
1.
Art and Science of the Cellular Mesoscale.
Trends Biochem Sci
; 45(6): 472-483, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32413324
2.
Icosahedral virus structures and the protein data bank.
J Biol Chem
; 296: 100554, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33744290
3.
Structure-based virtual screening workflow to identify antivirals targeting HIV-1 capsid.
J Comput Aided Mol Des
; 36(3): 193-203, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35262811
4.
Proteome-wide covalent ligand discovery in native biological systems.
Nature
; 534(7608): 570-4, 2016 06 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27309814
5.
Integrative modeling of the HIV-1 ribonucleoprotein complex.
PLoS Comput Biol
; 15(6): e1007150, 2019 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31194731
6.
Massive-Scale Binding Free Energy Simulations of HIV Integrase Complexes Using Asynchronous Replica Exchange Framework Implemented on the IBM WCG Distributed Network.
J Chem Inf Model
; 59(4): 1382-1397, 2019 04 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30758197
7.
cellPACK: a virtual mesoscope to model and visualize structural systems biology.
Nat Methods
; 12(1): 85-91, 2015 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25437435
8.
Dense Array of Spikes on HIV-1 Virion Particles.
J Virol
; 91(14)2017 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28446665
9.
A New Class of Allosteric HIV-1 Integrase Inhibitors Identified by Crystallographic Fragment Screening of the Catalytic Core Domain.
J Biol Chem
; 291(45): 23569-23577, 2016 Nov 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27645997
10.
Computational challenges of structure-based approaches applied to HIV.
Curr Top Microbiol Immunol
; 389: 31-51, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25711462
11.
AutoDockFR: Advances in Protein-Ligand Docking with Explicitly Specified Binding Site Flexibility.
PLoS Comput Biol
; 11(12): e1004586, 2015 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26629955
12.
Fragment-Based Analysis of Ligand Dockings Improves Classification of Actives.
J Chem Inf Model
; 56(8): 1597-607, 2016 08 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27384036
13.
A virtual screen discovers novel, fragment-sized inhibitors of Mycobacterium tuberculosis InhA.
J Chem Inf Model
; 55(3): 645-59, 2015 Mar 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25636146
14.
AutoDock4(Zn): an improved AutoDock force field for small-molecule docking to zinc metalloproteins.
J Chem Inf Model
; 54(8): 2371-9, 2014 Aug 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24931227
15.
Virtual screening with AutoDock Vina and the common pharmacophore engine of a low diversity library of fragments and hits against the three allosteric sites of HIV integrase: participation in the SAMPL4 protein-ligand binding challenge.
J Comput Aided Mol Des
; 28(4): 429-441, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24493410
16.
Blind prediction of HIV integrase binding from the SAMPL4 challenge.
J Comput Aided Mol Des
; 28(4): 327-45, 2014 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24595873
17.
Virtual screening of integrase inhibitors by large scale binding free energy calculations: the SAMPL4 challenge.
J Comput Aided Mol Des
; 28(4): 475-90, 2014 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24504704
18.
Identification of clickable HIV-1 capsid-targeting probes for viral replication inhibition.
Cell Chem Biol
; 31(3): 477-486.e7, 2024 Mar 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38518746
19.
Visualizing biological data-now and in the future.
Nat Methods
; 7(3 Suppl): S2-4, 2010 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20195254
20.
Visualization of macromolecular structures.
Nat Methods
; 7(3 Suppl): S42-55, 2010 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20195256