Detalles de la búsqueda
1.
The stability and number of nucleating interactions determine DNA hybridization rates in the absence of secondary structure.
Nucleic Acids Res
; 50(14): 7829-7841, 2022 08 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35880577
2.
A universal method for analyzing copolymer growth.
J Chem Phys
; 158(10): 104906, 2023 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36922142
3.
Minimal mechanism for cyclic templating of length-controlled copolymers under isothermal conditions.
J Chem Phys
; 156(7): 074103, 2022 Feb 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35183080
4.
Nonequilibrium correlations in minimal dynamical models of polymer copying.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(6): 1946-1951, 2019 02 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30659156
5.
In situ Generation of RNA Complexes for Synthetic Molecular Strand-Displacement Circuits in Autonomous Systems.
Nano Lett
; 21(1): 265-271, 2021 01 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33275434
6.
Guiding the folding pathway of DNA origami.
Nature
; 525(7567): 82-6, 2015 Sep 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26287459
7.
Modeling DNA-Strand Displacement Reactions in the Presence of Base-Pair Mismatches.
J Am Chem Soc
; 142(26): 11451-11463, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32496760
8.
Optimizing enzymatic catalysts for rapid turnover of substrates with low enzyme sequestration.
Biol Cybern
; 114(6): 653-668, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33044662
9.
DNA bipedal motor walking dynamics: an experimental and theoretical study of the dependency on step size.
Nucleic Acids Res
; 46(3): 1553-1561, 2018 02 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29294083
10.
Coarse-grained simulation of DNA using LAMMPS : An implementation of the oxDNA model and its applications.
Eur Phys J E Soft Matter
; 41(5): 57, 2018 May 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29748779
11.
Multi-scale coarse-graining for the study of assembly pathways in DNA-brick self-assembly.
J Chem Phys
; 148(13): 134910, 2018 Apr 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29626893
12.
The importance of thermodynamics for molecular systems, and the importance of molecular systems for thermodynamics.
Nat Comput
; 17(1): 3-29, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29576756
13.
Fundamental Costs in the Production and Destruction of Persistent Polymer Copies.
Phys Rev Lett
; 118(15): 158103, 2017 Apr 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28452507
14.
Publisher's Note: Biochemical Machines for the Interconversion of Mutual Information and Work [Phys. Rev. Lett. 118, 028101 (2017)].
Phys Rev Lett
; 118(4): 049902, 2017 Jan 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28186800
15.
Biochemical Machines for the Interconversion of Mutual Information and Work.
Phys Rev Lett
; 118(2): 028101, 2017 Jan 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28128612
16.
Multiscale simulations of anisotropic particles combining molecular dynamics and Green's function reaction dynamics.
J Chem Phys
; 146(11): 114106, 2017 Mar 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28330367
17.
DNA hairpins destabilize duplexes primarily by promoting melting rather than by inhibiting hybridization.
Nucleic Acids Res
; 43(13): 6181-90, 2015 Jul 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26056172
18.
Modelling toehold-mediated RNA strand displacement.
Biophys J
; 108(5): 1238-47, 2015 Mar 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25762335
19.
Modelling DNA origami self-assembly at the domain level.
J Chem Phys
; 143(16): 165102, 2015 Oct 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26520554
20.
Characterizing the bending and flexibility induced by bulges in DNA duplexes.
J Chem Phys
; 142(16): 165101, 2015 Apr 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25933790