Detalles de la búsqueda
1.
EPIK: precise and scalable evolutionary placement with informative k-mers.
Bioinformatics
; 39(12)2023 12 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37975872
2.
PEWO: a collection of workflows to benchmark phylogenetic placement.
Bioinformatics
; 36(21): 5264-5266, 2021 01 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32697844
3.
Rapid screening and detection of inter-type viral recombinants using phylo-k-mers.
Bioinformatics
; 36(22-23): 5351-5360, 2021 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33331849
4.
On the inference of complex phylogenetic networks by Markov Chain Monte-Carlo.
PLoS Comput Biol
; 17(9): e1008380, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34478440
5.
A phylogenetic approach for weighting genetic sequences.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 285, 2021 May 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34049487
6.
Computing the probability of gene trees concordant with the species tree in the multispecies coalescent.
Theor Popul Biol
; 137: 22-31, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33333117
7.
Rapid alignment-free phylogenetic identification of metagenomic sequences.
Bioinformatics
; 35(18): 3303-3312, 2019 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30698645
8.
Finding a most parsimonious or likely tree in a network with respect to an alignment.
J Math Biol
; 78(1-2): 527-547, 2019 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30121824
9.
Rearrangement moves on rooted phylogenetic networks.
PLoS Comput Biol
; 13(8): e1005611, 2017 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28763439
10.
Fast and accurate branch lengths estimation for phylogenomic trees.
BMC Bioinformatics
; 17: 23, 2016 Jan 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26744021
11.
Reconstructible phylogenetic networks: do not distinguish the indistinguishable.
PLoS Comput Biol
; 11(4): e1004135, 2015 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25849429
12.
Do Branch Lengths Help to Locate a Tree in a Phylogenetic Network?
Bull Math Biol
; 78(9): 1773-1795, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27659024
13.
Combinatorics of distance-based tree inference.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 109(41): 16443-8, 2012 Oct 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23012403
14.
Computing Phylo- k-Mers.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 20(5): 2889-2897, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37204943
15.
Robustness of phylogenetic inference based on minimum evolution.
Bull Math Biol
; 72(7): 1820-39, 2010 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20449671
16.
Determination and validation of principal gene products.
Bioinformatics
; 24(1): 11-7, 2008 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18006548
17.
Distribution of phylogenetic diversity under random extinction.
J Theor Biol
; 251(2): 286-96, 2008 Mar 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18199459
18.
Species choice for comparative genomics: being greedy works.
PLoS Genet
; 1(6): e71, 2005 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16327885
19.
Approximate maximum parsimony and ancestral maximum likelihood.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 7(1): 183-7, 2010.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20150680
20.
Budgeted phylogenetic diversity on circular split systems.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 6(1): 22-9, 2009.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19179696