Detalles de la búsqueda
1.
UTRdb 2.0: a comprehensive, expert curated catalog of eukaryotic mRNAs untranslated regions.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D337-D344, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36399486
2.
Next generation sequencing of SARS-CoV-2 genomes: challenges, applications and opportunities.
Brief Bioinform
; 22(2): 616-630, 2021 03 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33279989
3.
Sox2 controls neural stem cell self-renewal through a Fos-centered gene regulatory network.
Stem Cells
; 39(8): 1107-1119, 2021 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33739574
4.
Birth, evolution, and transmission of satellite-free mammalian centromeric domains.
Genome Res
; 28(6): 789-799, 2018 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29712753
5.
On the NF-Y regulome as in ENCODE (2019).
PLoS Comput Biol
; 16(12): e1008488, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33370256
6.
Epigenetic signatures of stress adaptation and flowering regulation in response to extended drought and recovery in Zea mays.
Plant Cell Environ
; 43(1): 55-75, 2020 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31677283
7.
RNentropy: an entropy-based tool for the detection of significant variation of gene expression across multiple RNA-Seq experiments.
Nucleic Acids Res
; 46(8): e46, 2018 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29390085
8.
hmSEEKER: Identification of hmSILAC Doublets in MaxQuant Output Data.
Proteomics
; 19(5): e1800300, 2019 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30656827
9.
Chromatin proteomics reveals novel combinatorial histone modification signatures that mark distinct subpopulations of macrophage enhancers.
Nucleic Acids Res
; 45(21): 12195-12213, 2017 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28981749
10.
Sox2 conditional mutation in mouse causes ataxic symptoms, cerebellar vermis hypoplasia, and postnatal defects of Bergmann glia.
Glia
; 66(9): 1929-1946, 2018 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29732603
11.
Resetting cancer stem cell regulatory nodes upon MYC inhibition.
EMBO Rep
; 17(12): 1872-1889, 2016 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27852622
12.
A high definition look at the NF-Y regulome reveals genome-wide associations with selected transcription factors.
Nucleic Acids Res
; 44(10): 4684-702, 2016 06 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26896797
13.
Trans-Reactivation: A New Epigenetic Phenomenon Underlying Transcriptional Reactivation of Silenced Genes.
PLoS Genet
; 11(8): e1005444, 2015 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26292210
14.
NF-Y coassociates with FOS at promoters, enhancers, repetitive elements, and inactive chromatin regions, and is stereo-positioned with growth-controlling transcription factors.
Genome Res
; 23(8): 1195-209, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23595228
15.
Motif discovery and transcription factor binding sites before and after the next-generation sequencing era.
Brief Bioinform
; 14(2): 225-37, 2013 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22517426
16.
PscanChIP: Finding over-represented transcription factor-binding site motifs and their correlations in sequences from ChIP-Seq experiments.
Nucleic Acids Res
; 41(Web Server issue): W535-43, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23748563
17.
SpliceAid-F: a database of human splicing factors and their RNA-binding sites.
Nucleic Acids Res
; 41(Database issue): D125-31, 2013 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23118479
18.
Widespread generation of alternative UTRs contributes to sex-specific RNA binding by UNR.
RNA
; 18(1): 53-64, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22101243
19.
Cscan: finding common regulators of a set of genes by using a collection of genome-wide ChIP-seq datasets.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W510-5, 2012 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22669907
20.
MitoZoa 2.0: a database resource and search tools for comparative and evolutionary analyses of mitochondrial genomes in Metazoa.
Nucleic Acids Res
; 40(Database issue): D1168-72, 2012 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22123747