Detalles de la búsqueda
1.
Machine learning predictions of MHC-II specificities reveal alternative binding mode of class II epitopes.
Immunity
; 56(6): 1359-1375.e13, 2023 06 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37023751
2.
SwissDock 2024: major enhancements for small-molecule docking with Attracting Cavities and AutoDock Vina.
Nucleic Acids Res
; 2024 Apr 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38686803
3.
SwissParam 2023: A Modern Web-Based Tool for Efficient Small Molecule Parametrization.
J Chem Inf Model
; 63(21): 6469-6475, 2023 11 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37853543
4.
The SwissSimilarity 2021 Web Tool: Novel Chemical Libraries and Additional Methods for an Enhanced Ligand-Based Virtual Screening Experience.
Int J Mol Sci
; 23(2)2022 Jan 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35054998
5.
Genetic Algorithm Based Design and Experimental Characterization of a Highly Thermostable Metalloprotein.
J Am Chem Soc
; 140(13): 4517-4521, 2018 04 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29336153
6.
The Structure of the Protonated Serine Octamer.
J Am Chem Soc
; 140(24): 7554-7560, 2018 06 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29637771
7.
Genetic-Algorithm-Based Optimization of a Peptidic Scaffold for Sequestration and Hydration of CO2.
Chemphyschem
; 17(23): 3831-3835, 2016 Dec 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27706880
8.
Lessons from nature: computational design of biomimetic compounds and processes.
Chimia (Aarau)
; 68(9): 642-7, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25437785
9.
Identification of clinically relevant T cell receptors for personalized T cell therapy using combinatorial algorithms.
Nat Biotechnol
; 2024 May 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38714897
10.
Neoantigen-specific CD8 T cells with high structural avidity preferentially reside in and eliminate tumors.
Nat Commun
; 14(1): 3188, 2023 06 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37280206
11.
Structural Prediction of Peptide-MHC Binding Modes.
Methods Mol Biol
; 2405: 245-282, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35298818
12.
Sensitive identification of neoantigens and cognate TCRs in human solid tumors.
Nat Biotechnol
; 40(5): 656-660, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34782741
13.
Deciphering the Mechanisms of Improved Immunogenicity of Hypochlorous Acid-Treated Antigens in Anti-Cancer Dendritic Cell-Based Vaccines.
Vaccines (Basel)
; 8(2)2020 Jun 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32498431
14.
Analysis of Secondary Structure Biases in Naturally Presented HLA-I Ligands.
Front Immunol
; 10: 2731, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31824508
15.
Cryogenic Spectroscopy and Quantum Molecular Dynamics Determine the Structure of Cyclic Intermediates Involved in Peptide Sequence Scrambling.
J Phys Chem Lett
; 6(13): 2524-9, 2015 Jul 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26266729
16.
Establishing the catalytic mechanism of human pancreatic α-amylase with QM/MM methods.
J Chem Theory Comput
; 11(6): 2508-16, 2015 Jun 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26575550
17.
Infrared Spectroscopy of Mobility-Selected H+-Gly-Pro-Gly-Gly (GPGG).
J Am Soc Mass Spectrom
; 26(9): 1444-54, 2015 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26091889
18.
Computational Alanine Scanning Mutagenesis: MM-PBSA vs TI.
J Chem Theory Comput
; 9(3): 1311-9, 2013 Mar 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26587593
19.
The extracellular subunit interface of the 5-HT3 receptors: a computational alanine scanning mutagenesis study.
J Biomol Struct Dyn
; 30(3): 280-98, 2012.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22694192
20.
Detection of farnesyltransferase interface hot spots through computational alanine scanning mutagenesis.
J Phys Chem B
; 115(51): 15339-54, 2011 Dec 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22060104