Detalles de la búsqueda
1.
Predicting genotype-specific gene regulatory networks.
Genome Res
; 32(3): 524-533, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35193937
2.
GRAND: a database of gene regulatory network models across human conditions.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D610-D621, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34508353
3.
Alternative poly-adenylation modulates α1-antitrypsin expression in chronic obstructive pulmonary disease.
PLoS Genet
; 17(11): e1009912, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34784346
4.
Protein kinases PknA and PknB independently and coordinately regulate essential Mycobacterium tuberculosis physiologies and antimicrobial susceptibility.
PLoS Pathog
; 16(4): e1008452, 2020 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32255801
5.
Cigarette smoking-associated isoform switching and 3' UTR lengthening via alternative polyadenylation.
Genomics
; 113(6): 4184-4195, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34763026
6.
Nongenic cancer-risk SNPs affect oncogenes, tumour-suppressor genes, and immune function.
Br J Cancer
; 122(4): 569-577, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31806877
7.
An online notebook resource for reproducible inference, analysis and publication of gene regulatory networks.
Nat Methods
; 19(5): 511-513, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35459940
8.
Exploring regulation in tissues with eQTL networks.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(37): E7841-E7850, 2017 09 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28851834
9.
Ensemble genomic analysis in human lung tissue identifies novel genes for chronic obstructive pulmonary disease.
Hum Genomics
; 12(1): 1, 2018 01 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29335020
10.
Tissue-aware RNA-Seq processing and normalization for heterogeneous and sparse data.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 437, 2017 Oct 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28974199
11.
Regulatory network changes between cell lines and their tissues of origin.
BMC Genomics
; 18(1): 723, 2017 Sep 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28899340
12.
Bipartite Community Structure of eQTLs.
PLoS Comput Biol
; 12(9): e1005033, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27618581
13.
Thermodynamic measures of cancer: Gibbs free energy and entropy of protein-protein interactions.
J Biol Phys
; 42(3): 339-50, 2016 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27012959
14.
Complex Traits Heritability is Highly Clustered in the eQTL Bipartite Network.
bioRxiv
; 2024 Mar 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38464142
15.
Polygenic and transcriptional risk scores identify chronic obstructive pulmonary disease subtypes.
medRxiv
; 2024 May 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38826461
16.
The Network Zoo: a multilingual package for the inference and analysis of gene regulatory networks.
Genome Biol
; 24(1): 45, 2023 03 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36894939
17.
Connectivity in eQTL networks dictates reproducibility and genomic properties.
Cell Rep Methods
; 2(5): 100218, 2022 05 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35637906
18.
Gene Targeting in Disease Networks.
Front Genet
; 12: 649942, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33968133
19.
Gene regulatory network inference as relaxed graph matching.
Proc AAAI Conf Artif Intell
; 35(11): 10263-10272, 2021 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34707916
20.
Multi-omic regulatory networks capture downstream effects of kinase inhibition in Mycobacterium tuberculosis.
NPJ Syst Biol Appl
; 7(1): 8, 2021 01 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33514755