Detalles de la búsqueda
1.
AlphaFold predictions are valuable hypotheses and accelerate but do not replace experimental structure determination.
Nat Methods
; 21(1): 110-116, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38036854
2.
Improved AlphaFold modeling with implicit experimental information.
Nat Methods
; 19(11): 1376-1382, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36266465
3.
Sizes of pure and doped helium droplets from single shot x-ray imaging.
J Chem Phys
; 156(4): 041102, 2022 Jan 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35105059
4.
The Phenix-AlphaFold webservice: Enabling AlphaFold predictions for use in Phenix.
Protein Sci
; 33(5): e4992, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38647406
5.
In situ ligand restraints from quantum-mechanical methods.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 79(Pt 2): 100-110, 2023 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36762856
6.
Conformational space exploration of cryo-EM structures by variability refinement.
Biochim Biophys Acta Biomembr
; 1865(4): 184133, 2023 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36738875
7.
Improved joint X-ray and neutron refinement procedure in Phenix.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 79(Pt 12): 1079-1093, 2023 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37942718
8.
Interpreting macromolecular diffraction through simulation.
Methods Enzymol
; 688: 195-222, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37748827
9.
Accelerating crystal structure determination with iterative AlphaFold prediction.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 79(Pt 3): 234-244, 2023 Mar 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36876433
10.
Structure determination of Pt-coated Au dumbbells via fluctuation X-ray scattering.
J Synchrotron Radiat
; 19(Pt 5): 695-700, 2012 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22898947
11.
Putting AlphaFold models to work with phenix.process_predicted_model and ISOLDE.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 78(Pt 11): 1303-1314, 2022 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36322415
12.
CERES: a cryo-EM re-refinement system for continuous improvement of deposited models.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 77(Pt 1): 48-61, 2021 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33404525
13.
Detection and correction of underassigned rotational symmetry prior to structure deposition.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
; 66(Pt 5): 503-13, 2010 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20445225
14.
Application of normal-mode refinement to X-ray crystal structures at the lower resolution limit.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
; 65(Pt 7): 633-43, 2009 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19564683
15.
Structural improvement of unliganded simian immunodeficiency virus gp120 core by normal-mode-based X-ray crystallographic refinement.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
; 65(Pt 4): 339-47, 2009 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19307715
16.
Normal-mode refinement of anisotropic thermal parameters for potassium channel KcsA at 3.2 A crystallographic resolution.
Structure
; 15(8): 955-62, 2007 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17698000
17.
Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in Phenix.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 75(Pt 10): 861-877, 2019 Oct 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31588918
18.
Interactive comparison and remediation of collections of macromolecular structures.
Protein Sci
; 27(1): 182-194, 2018 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28901593
19.
New tools for the analysis and validation of cryo-EM maps and atomic models.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 74(Pt 9): 814-840, 2018 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30198894
20.
Real-space refinement in PHENIX for cryo-EM and crystallography.
Acta Crystallogr D Struct Biol
; 74(Pt 6): 531-544, 2018 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29872004