Detalles de la búsqueda
1.
RNAdvisor: a comprehensive benchmarking tool for the measure and prediction of RNA structural model quality.
Brief Bioinform
; 25(2)2024 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38436560
2.
C-RCPred: a multi-objective algorithm for interactive secondary structure prediction of RNA complexes integrating user knowledge and SHAPE data.
Brief Bioinform
; 24(4)2023 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37337745
3.
IRSOM2: a web server for predicting bifunctional RNAs.
Nucleic Acids Res
; 51(W1): W281-W288, 2023 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37158254
4.
SWORD2: hierarchical analysis of protein 3D structures.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W732-W738, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35580056
5.
Over-expression of Dyrk1A affects bleeding by modulating plasma fibronectin and fibrinogen level in mice.
J Cell Mol Med
; 27(15): 2228-2238, 2023 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37415307
6.
InterEvDock3: a combined template-based and free docking server with increased performance through explicit modeling of complex homologs and integration of covariation-based contact maps.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W277-W284, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33978743
7.
Proteo3Dnet: a web server for the integration of structural information with interactomics data.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W567-W572, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33963857
8.
DaReUS-Loop: a web server to model multiple loops in homology models.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W423-W428, 2019 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31114872
9.
Probing Protein Interaction Networks by Combining MS-Based Proteomics and Structural Data Integration.
J Proteome Res
; 19(7): 2807-2820, 2020 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32338910
10.
KNOTTIN: the database of inhibitor cystine knot scaffold after 10 years, toward a systematic structure modeling.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D454-D458, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29136213
11.
OREMPRO web server: orientation and assessment of atomistic and coarse-grained structures of membrane proteins.
Bioinformatics
; 32(16): 2548-50, 2016 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153644
12.
Improving protein fold recognition with hybrid profiles combining sequence and structure evolution.
Bioinformatics
; 31(23): 3782-9, 2015 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26254434
13.
Characterization of NrnA homologs from Mycobacterium tuberculosis and Mycoplasma pneumoniae.
RNA
; 18(1): 155-65, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22114320
14.
State-of-the-RNArt: benchmarking current methods for RNA 3D structure prediction.
NAR Genom Bioinform
; 6(2): lqae048, 2024 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38745991
15.
Identification of a putative chaperone involved in stress resistance and virulence in Francisella tularensis.
Infect Immun
; 79(4): 1428-39, 2011 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21245269
16.
Representations of protein structure for exploring the conformational space: A speed-accuracy trade-off.
Comput Struct Biotechnol J
; 19: 2618-2625, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34025948
17.
Identification of small RNAs in Francisella tularensis.
BMC Genomics
; 11: 625, 2010 Nov 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21067590
18.
An information gain-based approach for evaluating protein structure models.
Comput Struct Biotechnol J
; 18: 2228-2236, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32837711
19.
MyPMFs: a simple tool for creating statistical potentials to assess protein structural models.
Biochimie
; 151: 37-41, 2018 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29857183
20.
TMPL: a database of experimental and theoretical transmembrane protein models positioned in the lipid bilayer.
Database (Oxford)
; 2017(1)2017 01 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28365741