Detalles de la búsqueda
1.
Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantification.
Nat Methods
; 2024 Jun 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38849569
2.
Sequencing of individual barcoded cDNAs using Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies reveals platform-specific error patterns.
Genome Res
; 32(4): 726-737, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35301264
3.
Liquid drop of DNA libraries reveals total genome information.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(44): 27300-27306, 2020 11 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33087570
4.
Modulation of Notch Signaling at Early Stages of Differentiation of Human Induced Pluripotent Stem Cells to Dopaminergic Neurons.
Int J Mol Sci
; 24(2)2023 Jan 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36674941
5.
Pattern of TAAR5 Expression in the Human Brain Based on Transcriptome Datasets Analysis.
Int J Mol Sci
; 22(16)2021 Aug 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34445502
6.
Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly.
BMC Bioinformatics
; 21(Suppl 12): 302, 2020 Jul 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32703149
7.
Hybrid transcriptome sequencing approach improved assembly and gene annotation in Cynara cardunculus (L.).
BMC Genomics
; 21(1): 317, 2020 Aug 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32819282
8.
SGTK: a toolkit for visualization and assessment of scaffold graphs.
Bioinformatics
; 35(13): 2303-2305, 2019 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30475983
9.
rnaQUAST: a quality assessment tool for de novo transcriptome assemblies.
Bioinformatics
; 32(14): 2210-2, 2016 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153654
10.
Assembling short reads from jumping libraries with large insert sizes.
Bioinformatics
; 31(20): 3262-8, 2015 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26040456
11.
ExSPAnder: a universal repeat resolver for DNA fragment assembly.
Bioinformatics
; 30(12): i293-301, 2014 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24931996
12.
Accurate isoform discovery with IsoQuant using long reads.
Nat Biotechnol
; 41(7): 915-918, 2023 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36593406
13.
Pericentromeric satellite lncRNAs are induced in cancer-associated fibroblasts and regulate their functions in lung tumorigenesis.
Cell Death Dis
; 14(1): 19, 2023 01 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36635266
14.
Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantification.
bioRxiv
; 2023 Jul 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37546854
15.
MetaGT: A pipeline for de novo assembly of metatranscriptomes with the aid of metagenomic data.
Front Microbiol
; 13: 981458, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36386613
16.
Single-nuclei isoform RNA sequencing unlocks barcoded exon connectivity in frozen brain tissue.
Nat Biotechnol
; 40(7): 1082-1092, 2022 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35256815
17.
Seed Transcriptome Annotation Reveals Enhanced Expression of Genes Related to ROS Homeostasis and Ethylene Metabolism at Alternating Temperatures in Wild Cardoon.
Plants (Basel)
; 9(9)2020 Sep 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32961840
18.
Understanding complex dynamics of behavioral, neurochemical and transcriptomic changes induced by prolonged chronic unpredictable stress in zebrafish.
Sci Rep
; 10(1): 19981, 2020 11 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33203921
19.
rnaSPAdes: a de novo transcriptome assembler and its application to RNA-Seq data.
Gigascience
; 8(9)2019 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31494669
20.
Assembling single-cell genomes and mini-metagenomes from chimeric MDA products.
J Comput Biol
; 20(10): 714-37, 2013 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24093227