Detalles de la búsqueda
1.
MarkovHC: Markov hierarchical clustering for the topological structure of high-dimensional single-cell omics data with transition pathway and critical point detection.
Nucleic Acids Res
; 50(1): 46-56, 2022 01 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34850940
2.
A data-driven method to learn a jump diffusion process from aggregate biological gene expression data.
J Theor Biol
; 532: 110923, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34606876
3.
Characterizing the strand-specific distribution of non-CpG methylation in human pluripotent cells.
Nucleic Acids Res
; 42(5): 3009-16, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24343027
4.
An allosteric model of the inositol trisphosphate receptor with nonequilibrium binding.
Phys Biol
; 11(5): 056001, 2014 Aug 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25118617
5.
Adjustment method for microarray data generated using two-cycle RNA labeling protocol.
BMC Genomics
; 14: 31, 2013 Jan 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23324182
6.
Modular analysis of the probabilistic genetic interaction network.
Bioinformatics
; 27(6): 853-9, 2011 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21278184
7.
Kinetic behavior of the general modifier mechanism of Botts and Morales with non-equilibrium binding.
J Theor Biol
; 296: 13-20, 2012 Mar 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22100501
8.
Hybridization modeling of oligonucleotide SNP arrays for accurate DNA copy number estimation.
Nucleic Acids Res
; 37(17): e117, 2009 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19586935
9.
REMAS: a new regression model to identify alternative splicing events from exon array data.
BMC Bioinformatics
; 10 Suppl 1: S18, 2009 Jan 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19208117
10.
Searching for bidirectional promoters in Arabidopsis thaliana.
BMC Bioinformatics
; 10 Suppl 1: S29, 2009 Jan 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19208129
11.
Nonlinear cooperation of p53-ING1-induced bax expression and protein S-nitrosylation in GSNO-induced thymocyte apoptosis: a quantitative approach with cross-platform validation.
Apoptosis
; 14(2): 236-45, 2009 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19082896
12.
Gene-centric genomewide association study via entropy.
Genetics
; 179(1): 637-50, 2008 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18458106
13.
[Advances on bioinformatic research in transcription factor binding sites].
Yi Chuan
; 31(4): 365-73, 2009 Apr.
Artículo
en Zh
| MEDLINE | ID: mdl-19586888
14.
Conservation and implications of eukaryote transcriptional regulatory regions across multiple species.
BMC Genomics
; 9: 623, 2008 Dec 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19099599
15.
A remark on copy number variation detection methods.
PLoS One
; 13(4): e0196226, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29702671
16.
BL-Hi-C is an efficient and sensitive approach for capturing structural and regulatory chromatin interactions.
Nat Commun
; 8(1): 1622, 2017 11 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29158486
17.
Nonequilibrium Enhances Adaptation Efficiency of Stochastic Biochemical Systems.
PLoS One
; 11(5): e0155838, 2016.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27195482
18.
Features of coding and noncoding sequences based on 3-tuple distributions.
Yi Chuan Xue Bao
; 32(10): 1018-26, 2005 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16252696
19.
PDEGEM: Modeling non-uniform read distribution in RNA-Seq data.
BMC Med Genomics
; 8 Suppl 2: S14, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26044773
20.
Overshoot in biological systems modelled by Markov chains: a non-equilibrium dynamic phenomenon.
IET Syst Biol
; 8(4): 138-45, 2014 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25075526