Detalles de la búsqueda
1.
Surface Charge Can Modulate Phase Separation of Multidomain Proteins.
J Am Chem Soc
; 146(5): 3383-3395, 2024 Feb 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38262618
2.
Why Do Disordered and Structured Proteins Behave Differently in Phase Separation?
Trends Biochem Sci
; 43(7): 499-516, 2018 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29716768
3.
Both Ligands and Macromolecular Crowders Preferentially Bind to Closed Conformations of Maltose Binding Protein.
Biochemistry
; 58(17): 2208-2217, 2019 04 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30950267
4.
Intrinsically Disordered Protein Exhibits Both Compaction and Expansion under Macromolecular Crowding.
Biophys J
; 114(5): 1067-1079, 2018 03 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29539394
5.
Prediction of homoprotein and heteroprotein complexes by protein docking and template-based modeling: A CASP-CAPRI experiment.
Proteins
; 84 Suppl 1: 323-48, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27122118
6.
Characterizing protein kinase A (PKA) subunits as macromolecular regulators of PKA RIα liquid-liquid phase separation.
J Chem Phys
; 154(22): 221101, 2021 Jun 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34241191
7.
Calculating Structure Factors of Protein Solutions by Atomistic Modeling of Protein-Protein Interactions.
bioRxiv
; 2024 Mar 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38585905
8.
Using the concept of transient complex for affinity predictions in CAPRI rounds 20-27 and beyond.
Proteins
; 81(12): 2229-36, 2013 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23873496
9.
Folding free energy surfaces of three small proteins under crowding: validation of the postprocessing method by direct simulation.
Phys Biol
; 10(4): 045001, 2013 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23912849
10.
Prediction and dissection of widely-varying association rate constants of actin-binding proteins.
PLoS Comput Biol
; 8(10): e1002696, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23055910
11.
Predicting the Sequence-Dependent Backbone Dynamics of Intrinsically Disordered Proteins.
bioRxiv
; 2023 Feb 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36778236
12.
Atomistic Modeling of Liquid-Liquid Phase Equilibrium Explains Dependence of Critical Temperature on γ-Crystallin Sequence.
bioRxiv
; 2023 Apr 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37162827
13.
Atomistic modeling of liquid-liquid phase equilibrium explains dependence of critical temperature on γ-crystallin sequence.
Commun Biol
; 6(1): 886, 2023 08 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37644195
14.
Calculating Binodals and Interfacial Tension of Phase-Separated Condensates from Molecular Simulations with Finite-Size Corrections.
Methods Mol Biol
; 2563: 1-35, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36227466
15.
Contrasting factors on the kinetic path to protein complex formation diminish the effects of crowding agents.
Biophys J
; 103(5): 1011-9, 2012 Sep 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23009850
16.
A method for computing association rate constants of atomistically represented proteins under macromolecular crowding.
Phys Biol
; 9(6): 066008, 2012 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23197255
17.
Dissection of the high rate constant for the binding of a ribotoxin to the ribosome.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 106(17): 6974-9, 2009 Apr 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19346475
18.
ReSMAP: Web Server for Predicting Residue-Specific Membrane-Association Propensities of Intrinsically Disordered Proteins.
Membranes (Basel)
; 12(8)2022 Aug 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36005688
19.
Preferential Interactions of a Crowder Protein with the Specific Binding Site of a Native Protein Complex.
J Phys Chem Lett
; 13(3): 792-800, 2022 Jan 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35044179
20.
Rationalizing 5000-fold differences in receptor-binding rate constants of four cytokines.
Biophys J
; 101(5): 1175-83, 2011 Sep 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21889455