Detalles de la búsqueda
1.
scMNMF: a novel method for single-cell multi-omics clustering based on matrix factorization.
Brief Bioinform
; 25(3)2024 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38754408
2.
ConSpaS: a contrastive learning framework for identifying spatial domains by integrating local and global similarities.
Brief Bioinform
; 24(6)2023 Sep 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37965808
3.
SSNMDI: a novel joint learning model of semi-supervised non-negative matrix factorization and data imputation for clustering of single-cell RNA-seq data.
Brief Bioinform
; 24(3)2023 05 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37122068
4.
scTPC: a novel semisupervised deep clustering model for scRNA-seq data.
Bioinformatics
; 40(5)2024 May 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38684178
5.
MDICC: novel method for multi-omics data integration and cancer subtype identification.
Brief Bioinform
; 23(3)2022 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35437603
6.
PCB: A pseudotemporal causality-based Bayesian approach to identify EMT-associated regulatory relationships of AS events and RBPs during breast cancer progression.
PLoS Comput Biol
; 19(3): e1010939, 2023 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36930678
7.
Matrix factorization-based data fusion for the prediction of RNA-binding proteins and alternative splicing event associations during epithelial-mesenchymal transition.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34410342
8.
Prediction of RNA-binding protein and alternative splicing event associations during epithelial-mesenchymal transition based on inductive matrix completion.
Brief Bioinform
; 22(5)2021 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33517359
9.
A combinatorially regulated RNA splicing signature predicts breast cancer EMT states and patient survival.
RNA
; 26(9): 1257-1267, 2020 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32467311
10.
Coregulation of alternative splicing by hnRNPM and ESRP1 during EMT.
RNA
; 24(10): 1326-1338, 2018 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30042172
11.
A systematic framework to derive N-glycan biosynthesis process and the automated construction of glycosylation networks.
BMC Bioinformatics
; 17 Suppl 7: 240, 2016 Jul 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27454116
12.
SMCC: A Novel Clustering Method for Single- and Multi-Omics Data Based on Co-Regularized Network Fusion.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; PP2024 Jan 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38215334
13.
scHOIS: Determining Cell Heterogeneity Through Hierarchical Clustering Based on Optimal Imputation Strategy.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 20(2): 1431-1444, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37815942
14.
Identification of a comprehensive alternative splicing function during epithelial-mesenchymal transition.
iScience
; 26(4): 106517, 2023 Apr 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37123236
15.
Unsupervised Learning Framework With Multidimensional Scaling in Predicting Epithelial-Mesenchymal Transitions.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 18(6): 2714-2723, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32386162
16.
Drug Side-Effect Profiles Prediction: From Empirical to Structural Risk Minimization.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 17(2): 402-410, 2020.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29994681
17.
On predicting epithelial mesenchymal transition by integrating RNA-binding proteins and correlation data via L1/2-regularization method.
Artif Intell Med
; 95: 96-103, 2019 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30352711
18.
Exploring Observability of Attractor Cycles in Boolean Networks for Biomarker Detection.
IEEE Access
; 7: 127745-127753, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33598376
19.
Discovery of Boolean metabolic networks: integer linear programming based approach.
BMC Syst Biol
; 12(Suppl 1): 7, 2018 04 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29671395
20.
Integer programming-based method for observability of singleton attractors in Boolean networks.
IET Syst Biol
; 11(1): 30-35, 2017 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28303791