Detalles de la búsqueda
1.
Machine learning predictions of MHC-II specificities reveal alternative binding mode of class II epitopes.
Immunity
; 56(6): 1359-1375.e13, 2023 06 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37023751
2.
Contemplating immunopeptidomes to better predict them.
Semin Immunol
; 66: 101708, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36621290
3.
The MHC Motif Atlas: a database of MHC binding specificities and ligands.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D428-D437, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36318236
4.
Mass Spectrometry Based Immunopeptidomics Leads to Robust Predictions of Phosphorylated HLA Class I Ligands.
Mol Cell Proteomics
; 19(2): 390-404, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31848261
5.
The Length Distribution and Multiple Specificity of Naturally Presented HLA-I Ligands.
J Immunol
; 201(12): 3705-3716, 2018 12 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30429286
6.
High-throughput and Sensitive Immunopeptidomics Platform Reveals Profound Interferonγ-Mediated Remodeling of the Human Leukocyte Antigen (HLA) Ligandome.
Mol Cell Proteomics
; 17(3): 533-548, 2018 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29242379
7.
Analysis of Translation Elongation Dynamics in the Context of an Escherichia coli Cell.
Biophys J
; 110(9): 2120-31, 2016 05 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27166819
8.
Noise analysis of genome-scale protein synthesis using a discrete computational model of translation.
J Chem Phys
; 143(4): 044109, 2015 Jul 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26233109
9.
A genome-scale integration and analysis of Lactococcus lactis translation data.
PLoS Comput Biol
; 9(10): e1003240, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24130467
10.
Improved predictions of antigen presentation and TCR recognition with MixMHCpred2.2 and PRIME2.0 reveal potent SARS-CoV-2 CD8+ T-cell epitopes.
Cell Syst
; 14(1): 72-83.e5, 2023 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36603583
11.
A computational framework for the design of optimal protein synthesis.
Biotechnol Bioeng
; 109(8): 2127-33, 2012 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22334333
12.
Deciphering the landscape of phosphorylated HLA-II ligands.
iScience
; 25(5): 104215, 2022 May 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35494241
13.
Inflammatory B cells correlate with failure to checkpoint blockade in melanoma patients.
Oncoimmunology
; 10(1): 1873585, 2021 02 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33643691
14.
Prediction of neo-epitope immunogenicity reveals TCR recognition determinants and provides insight into immunoediting.
Cell Rep Med
; 2(2): 100194, 2021 02 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33665637
15.
EPIC: A Tool to Estimate the Proportions of Different Cell Types from Bulk Gene Expression Data.
Methods Mol Biol
; 2120: 233-248, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32124324
16.
Cathepsin S Regulates Antigen Processing and T Cell Activity in Non-Hodgkin Lymphoma.
Cancer Cell
; 37(5): 674-689.e12, 2020 05 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32330455
17.
Robust prediction of HLA class II epitopes by deep motif deconvolution of immunopeptidomes.
Nat Biotechnol
; 37(11): 1283-1286, 2019 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31611696
18.
A Phase Ib Study of the Combination of Personalized Autologous Dendritic Cell Vaccine, Aspirin, and Standard of Care Adjuvant Chemotherapy Followed by Nivolumab for Resected Pancreatic Adenocarcinoma-A Proof of Antigen Discovery Feasibility in Three Patients.
Front Immunol
; 10: 1832, 2019.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31440238
19.
Immunopeptidomics of colorectal cancer organoids reveals a sparse HLA class I neoantigen landscape and no increase in neoantigens with interferon or MEK-inhibitor treatment.
J Immunother Cancer
; 7(1): 309, 2019 11 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31735170
20.
Personalized cancer vaccine effectively mobilizes antitumor T cell immunity in ovarian cancer.
Sci Transl Med
; 10(436)2018 04 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29643231