Detalles de la búsqueda
1.
PRAWNS: compact pan-genomic features for whole-genome population genomics.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36579850
2.
Assessment of plasmids for relating the 2020 Salmonella enterica serovar Newport onion outbreak to farms implicated by the outbreak investigation.
BMC Genomics
; 24(1): 165, 2023 Apr 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37016310
3.
The worm Adult Activity Test (wAAT): A de novo mathematical model for detecting acute chemical effects in Caenorhabditis elegans.
J Appl Toxicol
; 43(12): 1899-1915, 2023 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37551865
4.
Interpretative Labor and the Bane of Nonstandardized Metadata in Public Health Surveillance and Food Safety.
Clin Infect Dis
; 73(8): 1537-1539, 2021 10 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34240118
5.
Evaluating the accuracy of Listeria monocytogenes assemblies from quasimetagenomic samples using long and short reads.
BMC Genomics
; 22(1): 389, 2021 May 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34039264
6.
GalaxyTrakr: a distributed analysis tool for public health whole genome sequence data accessible to non-bioinformaticians.
BMC Genomics
; 22(1): 114, 2021 Feb 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33568057
7.
Genomic diversity of Salmonella enterica isolated from papaya samples collected during multiple outbreaks in 2017.
Microbiology (Reading)
; 166(5): 453-459, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32100709
8.
Phylogenomic Pipeline Validation for Foodborne Pathogen Disease Surveillance.
J Clin Microbiol
; 57(5)2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30728194
9.
TreeToReads - a pipeline for simulating raw reads from phylogenies.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 178, 2017 Mar 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28320310
10.
Gene expression profiles normalized in psoriatic skin by treatment with brodalumab, a human anti-IL-17 receptor monoclonal antibody.
J Immunol
; 192(8): 3828-36, 2014 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24646743
11.
SARS-CoV-2 wastewater variant surveillance: pandemic response leveraging FDA's GenomeTrakr network.
mSystems
; 9(6): e0141523, 2024 Jun 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38819130
12.
Performance of methods for SARS-CoV-2 variant detection and abundance estimation within mixed population samples.
PeerJ
; 11: e14596, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36721781
13.
Application of quasimetagenomics methods to define microbial diversity and subtype Listeria monocytogenes in dairy and seafood production facilities.
Microbiol Spectr
; 11(6): e0148223, 2023 Dec 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37812012
14.
Using Evolutionary Analyses to Refine Whole-Genome Sequence Match Criteria.
Front Microbiol
; 13: 797997, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35875579
15.
Transient and resident pathogens: Intra-facility genetic diversity of Listeria monocytogenes and Salmonella from food production environments.
PLoS One
; 17(9): e0268470, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36048885
16.
Whole-Genome Assessment of Clinical Acinetobacter baumannii Isolates Uncovers Potentially Novel Factors Influencing Carbapenem Resistance.
Front Microbiol
; 12: 714284, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34659144
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Gen-FS coordinated proficiency test data for genomic foodborne pathogen surveillance, 2017 and 2018 exercises.
Sci Data
; 7(1): 402, 2020 11 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33214563
18.
Within-species contamination of bacterial whole-genome sequence data has a greater influence on clustering analyses than between-species contamination.
Genome Biol
; 20(1): 286, 2019 12 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31849328
19.
Whole genome sequencing uses for foodborne contamination and compliance: Discovery of an emerging contamination event in an ice cream facility using whole genome sequencing.
Infect Genet Evol
; 73: 214-220, 2019 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31039448
20.
Genetic Diversity of Salmonella and Listeria Isolates from Food Facilities.
J Food Prot
; 81(12): 2082-2089, 2018 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30485763