Detalles de la búsqueda
1.
DNA mismatches reveal conformational penalties in protein-DNA recognition.
Nature
; 587(7833): 291-296, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33087930
2.
NMR measurements of transient low-populated tautomeric and anionic Watson-Crick-like G·T/U in RNA:DNA hybrids: implications for the fidelity of transcription and CRISPR/Cas9 gene editing.
Nucleic Acids Res
; 52(5): 2672-2685, 2024 Mar 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38281263
3.
Dynamic basis for dAâ¢dGTP and dAâ¢d8OGTP misincorporation via Hoogsteen base pairs.
Nat Chem Biol
; 19(7): 900-910, 2023 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37095237
4.
Mapping the per-residue surface electrostatic potential of CAPRIN1 along its phase-separation trajectory.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(36): e2210492119, 2022 09 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36040869
5.
Measuring thermodynamic preferences to form non-native conformations in nucleic acids using ultraviolet melting.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(24): e2112496119, 2022 06 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35671421
6.
Surface electrostatics dictate RNA-binding protein CAPRIN1 condensate concentration and hydrodynamic properties.
J Biol Chem
; 299(1): 102776, 2023 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36496075
7.
Measurement of 1Hα transverse relaxation rates in proteins: application to solvent PREs.
J Biomol NMR
; 76(4): 137-152, 2022 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36018482
8.
2'-O-Methylation can increase the abundance and lifetime of alternative RNA conformational states.
Nucleic Acids Res
; 48(21): 12365-12379, 2020 12 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33104789
9.
Environmental Effects on Guanine-Thymine Mispair Tautomerization Explored with Quantum Mechanical/Molecular Mechanical Free Energy Simulations.
J Am Chem Soc
; 142(25): 11183-11191, 2020 06 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32459476
10.
Probing conformational transitions towards mutagenic Watson-Crick-like G·T mismatches using off-resonance sugar carbon R1ρ relaxation dispersion.
J Biomol NMR
; 74(8-9): 457-471, 2020 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32789613
11.
Why are Hoogsteen base pairs energetically disfavored in A-RNA compared to B-DNA?
Nucleic Acids Res
; 46(20): 11099-11114, 2018 11 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30285154
12.
Extending the Sensitivity of CEST NMR Spectroscopy to Micro-to-Millisecond Dynamics in Nucleic Acids Using High-Power Radio-Frequency Fields.
Angew Chem Int Ed Engl
; 59(28): 11262-11266, 2020 07 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32168407
13.
NMR Chemical Exchange Measurements Reveal That N6-Methyladenosine Slows RNA Annealing.
J Am Chem Soc
; 141(51): 19988-19993, 2019 12 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31826614
14.
Insights into Watson-Crick/Hoogsteen breathing dynamics and damage repair from the solution structure and dynamic ensemble of DNA duplexes containing m1A.
Nucleic Acids Res
; 45(9): 5586-5601, 2017 May 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28369571
15.
Atomic structures of excited state A-T Hoogsteen base pairs in duplex DNA by combining NMR relaxation dispersion, mutagenesis, and chemical shift calculations.
J Biomol NMR
; 70(4): 229-244, 2018 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29675775
16.
5-Oxyacetic Acid Modification Destabilizes Double Helical Stem Structures and Favors Anionic Watson-Crick like cmo5 U-G Base Pairs.
Chemistry
; 24(71): 18903-18906, 2018 Dec 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30300940
17.
A delayed decoupling methyl-TROSY pulse sequence for atomic resolution studies of folded proteins and RNAs in condensates.
J Magn Reson
; 362: 107667, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38626504
18.
Quantitative and systematic NMR measurements of sequence-dependent A-T Hoogsteen dynamics uncovers unique conformational specificity in the DNA double helix.
bioRxiv
; 2024 May 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38798635
19.
Practical considerations for the measurement of near-surface electrostatics based on solvent paramagnetic relaxation enhancements.
J Magn Reson
; 349: 107400, 2023 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36796143
20.
Sometimes pulses just have to be perfect - An example based on the measurement of amide proton transverse relaxation rates in proteins.
J Magn Reson
; 349: 107412, 2023 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36907132