Detalles de la búsqueda
1.
Visible Machine Learning for Biomedicine.
Cell
; 173(7): 1562-1565, 2018 06 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29906441
2.
Multiplatform analysis of 12 cancer types reveals molecular classification within and across tissues of origin.
Cell
; 158(4): 929-944, 2014 Aug 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25109877
3.
Spatial epigenome-transcriptome co-profiling of mammalian tissues.
Nature
; 616(7955): 113-122, 2023 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36922587
4.
Epigenetic regulation during cancer transitions across 11 tumour types.
Nature
; 623(7986): 432-441, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37914932
5.
Partial alignment of multislice spatially resolved transcriptomics data.
Genome Res
; 33(7): 1124-1132, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37553263
6.
Alignment and integration of spatial transcriptomics data.
Nat Methods
; 19(5): 567-575, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35577957
7.
A zero-agnostic model for copy number evolution in cancer.
PLoS Comput Biol
; 19(11): e1011590, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37943952
8.
Reconstruction of clone- and haplotype-specific cancer genome karyotypes from bulk tumor samples.
Genome Res
; 30(9): 1274-1290, 2020 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32887685
9.
netNMF-sc: leveraging gene-gene interactions for imputation and dimensionality reduction in single-cell expression analysis.
Genome Res
; 30(2): 195-204, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31992614
10.
Network propagation: a universal amplifier of genetic associations.
Nat Rev Genet
; 18(9): 551-562, 2017 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28607512
11.
Therapy-induced mutations drive the genomic landscape of relapsed acute lymphoblastic leukemia.
Blood
; 135(1): 41-55, 2020 01 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31697823
12.
Copy number evolution with weighted aberrations in cancer.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i344-i352, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657354
13.
Identifying tumor clones in sparse single-cell mutation data.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i186-i193, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657385
14.
STARCH: copy number and clone inference from spatial transcriptomics data.
Phys Biol
; 18(3): 035001, 2021 03 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33022659
15.
Single-cell sequencing data reveal widespread recurrence and loss of mutational hits in the life histories of tumors.
Genome Res
; 27(11): 1885-1894, 2017 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29030470
16.
GenomeVIP: a cloud platform for genomic variant discovery and interpretation.
Genome Res
; 27(8): 1450-1459, 2017 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28522612
17.
Expanding the computational toolbox for mining cancer genomes.
Nat Rev Genet
; 15(8): 556-70, 2014 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25001846
18.
Comprehensive Molecular Characterization of Papillary Renal-Cell Carcinoma.
N Engl J Med
; 374(2): 135-45, 2016 Jan 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26536169
19.
Haplotype phasing in single-cell DNA-sequencing data.
Bioinformatics
; 34(13): i211-i217, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29950014
20.
Identifying simultaneous rearrangements in cancer genomes.
Bioinformatics
; 34(2): 346-352, 2018 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29186385