Detalles de la búsqueda
1.
Searching similar local 3D micro-environments in protein structure databases with MicroMiner.
Brief Bioinform
; 24(6)2023 09 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37833838
2.
Enhanced Calculation of Property Distributions in Chemical Fragment Spaces.
J Chem Inf Model
; 64(6): 2008-2020, 2024 Mar 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38466793
3.
Redocking the PDB.
J Chem Inf Model
; 64(1): 219-237, 2024 Jan 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38108627
4.
Database-Driven Identification of Structurally Similar Protein-Protein Interfaces.
J Chem Inf Model
; 64(8): 3332-3349, 2024 Apr 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38470439
5.
User-centric design of a 3D search interface for protein-ligand complexes.
J Comput Aided Mol Des
; 38(1): 23, 2024 May 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38814371
6.
SpaceGrow: efficient shape-based virtual screening of billion-sized combinatorial fragment spaces.
J Comput Aided Mol Des
; 38(1): 13, 2024 Mar 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38493240
7.
ProteinsPlus: a comprehensive collection of web-based molecular modeling tools.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W611-W615, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35489057
8.
SiteMine: Large-scale binding site similarity searching in protein structure databases.
Arch Pharm (Weinheim)
; 357(5): e2300661, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38335311
9.
Binding Site Detection Remastered: Enabling Fast, Robust, and Reliable Binding Site Detection and Descriptor Calculation with DoGSite3.
J Chem Inf Model
; 63(10): 3128-3137, 2023 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37130052
10.
Modeling with Alternate Locations in X-ray Protein Structures.
J Chem Inf Model
; 63(8): 2573-2585, 2023 04 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37018549
11.
Full Modification Control over Retrosynthetic Routes for Guided Optimization of Lead Structures.
J Chem Inf Model
; 63(21): 6587-6597, 2023 11 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37910814
12.
PoseEdit: enhanced ligand binding mode communication by interactive 2D diagrams.
J Comput Aided Mol Des
; 37(10): 491-503, 2023 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37515714
13.
Galileo: Three-dimensional searching in large combinatorial fragment spaces on the example of pharmacophores.
J Comput Aided Mol Des
; 37(1): 1-16, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36418668
14.
Analyzing structural features of proteins from deep-sea organisms.
Proteins
; 90(8): 1521-1537, 2022 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35313380
15.
GeoMine: interactive pattern mining of protein-ligand interfaces in the Protein Data Bank.
Bioinformatics
; 37(3): 424-425, 2021 04 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32735322
16.
Calculating and Optimizing Physicochemical Property Distributions of Large Combinatorial Fragment Spaces.
J Chem Inf Model
; 62(11): 2800-2810, 2022 06 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35653228
17.
Synthesis-Aware Generation of Structural Analogues.
J Chem Inf Model
; 62(15): 3565-3576, 2022 08 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35867908
18.
Comparison of Combinatorial Fragment Spaces and Its Application to Ultralarge Make-on-Demand Compound Catalogs.
J Chem Inf Model
; 62(3): 553-566, 2022 02 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35050621
19.
Maximum Common Substructure Searching in Combinatorial Make-on-Demand Compound Spaces.
J Chem Inf Model
; 62(9): 2133-2150, 2022 05 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34478299
20.
Visualizing Generic Reaction Patterns.
J Chem Inf Model
; 62(19): 4680-4689, 2022 10 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36169383