Detalles de la búsqueda
1.
MGcount: a total RNA-seq quantification tool to address multi-mapping and multi-overlapping alignments ambiguity in non-coding transcripts.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 39, 2022 Jan 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35030988
2.
MOCCA: a flexible suite for modelling DNA sequence motif occurrence combinatorics.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 234, 2021 May 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33962556
3.
DNA sequence models of genome-wide Drosophila melanogaster Polycomb binding sites improve generalization to independent Polycomb Response Elements.
Nucleic Acids Res
; 47(15): 7781-7797, 2019 09 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31340029
4.
Precrec: fast and accurate precision-recall and ROC curve calculations in R.
Bioinformatics
; 33(1): 145-147, 2017 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27591081
5.
Comprehensive analysis of high-throughput screens with HiTSeekR.
Nucleic Acids Res
; 44(14): 6639-48, 2016 08 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27330136
6.
Correction: MGcount: a total RNA-seq quantification tool to address multi-mapping and multi-overlapping alignments ambiguity in non-coding transcripts.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 209, 2022 Jun 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35650556
7.
High-resolution analysis of parent-of-origin allelic expression in the Arabidopsis Endosperm.
PLoS Genet
; 7(6): e1002126, 2011 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21698132
8.
Response to Wang and Luo.
BMC Biol
; 10: 32, 2012 Apr 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22513177
9.
Polyploidization increases meiotic recombination frequency in Arabidopsis.
BMC Biol
; 9: 24, 2011 Apr 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21510849
10.
Gnocis: An integrated system for interactive and reproducible analysis and modelling of cis-regulatory elements in Python 3.
PLoS One
; 17(9): e0274338, 2022.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36084008
11.
Evolutionary plasticity of polycomb/trithorax response elements in Drosophila species.
PLoS Biol
; 6(10): e261, 2008 Oct 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18959483
12.
Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana.
Nucleic Acids Res
; 37(12): 4010-21, 2009 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19417064
13.
mkESA: enhanced suffix array construction tool.
Bioinformatics
; 25(8): 1084-5, 2009 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19246510
14.
Genome-wide prediction of Polycomb/Trithorax response elements in Drosophila melanogaster.
Dev Cell
; 5(5): 759-71, 2003 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-14602076
15.
RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible.
Nucleic Acids Res
; 34(Web Server issue): W451-4, 2006 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16845047
16.
jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements.
Nucleic Acids Res
; 34(Web Server issue): W546-50, 2006 Jul 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16845067
17.
Complete probabilistic analysis of RNA shapes.
BMC Biol
; 4: 5, 2006 Feb 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16480488
18.
Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics.
J Biotechnol
; 124(1): 41-55, 2006 Jun 25.
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| MEDLINE | ID: mdl-16530285
19.
Prediction of microRNA targets.
Methods Mol Biol
; 342: 87-99, 2006.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16957369
20.
Abstract shapes of RNA.
Nucleic Acids Res
; 32(16): 4843-51, 2004.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-15371549