Detalles de la búsqueda
1.
Linear: a framework to enable existing software to resolve structural variants in long reads with flexible and efficient alignment-free statistical models.
Brief Bioinform
; 24(2)2023 03 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36869850
2.
A simple refined DNA minimizer operator enables 2-fold faster computation.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38269626
3.
Lambda3: homology search for protein, nucleotide, and bisulfite-converted sequences.
Bioinformatics
; 40(3)2024 Mar 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38485699
4.
Mistle: bringing spectral library predictions to metaproteomics with an efficient search index.
Bioinformatics
; 39(6)2023 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37294786
5.
A multi-view latent variable model reveals cellular heterogeneity in complex tissues for paired multimodal single-cell data.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36622018
6.
Computational strategies to combat COVID-19: useful tools to accelerate SARS-CoV-2 and coronavirus research.
Brief Bioinform
; 22(2): 642-663, 2021 03 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33147627
7.
Needle: a fast and space-efficient prefilter for estimating the quantification of very large collections of expression experiments.
Bioinformatics
; 38(17): 4100-4108, 2022 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35801930
8.
LaRA 2: parallel and vectorized program for sequence-structure alignment of RNA sequences.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 18, 2022 Jan 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34991448
9.
RLM: fast and simplified extraction of read-level methylation metrics from bisulfite sequencing data.
Bioinformatics
; 37(21): 3934-3935, 2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34601556
10.
SCORE: Smart Consensus Of RNA Expression-a consensus tool for detecting differentially expressed genes in bacteria.
Bioinformatics
; 37(3): 426-428, 2021 04 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32717040
11.
Testing assembly strategies of Francisella tularensis genomes to infer an evolutionary conservation analysis of genomic structures.
BMC Genomics
; 22(1): 822, 2021 Nov 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34773979
12.
GenMap: ultra-fast computation of genome mappability.
Bioinformatics
; 36(12): 3687-3692, 2020 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32246826
13.
ganon: precise metagenomics classification against large and up-to-date sets of reference sequences.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i12-i20, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657362
14.
Ranbow: A fast and accurate method for polyploid haplotype reconstruction.
PLoS Comput Biol
; 16(5): e1007843, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32469863
15.
EPIFANY: A Method for Efficient High-Confidence Protein Inference.
J Proteome Res
; 19(3): 1060-1072, 2020 03 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31975601
16.
VARSCOT: variant-aware detection and scoring enables sensitive and personalized off-target detection for CRISPR-Cas9.
BMC Biotechnol
; 19(1): 40, 2019 06 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31248401
17.
OpenMS: a flexible open-source software platform for mass spectrometry data analysis.
Nat Methods
; 13(9): 741-8, 2016 08 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27575624
18.
Generic accelerated sequence alignment in SeqAn using vectorization and multi-threading.
Bioinformatics
; 34(20): 3437-3445, 2018 10 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29726911
19.
DREAM-Yara: an exact read mapper for very large databases with short update time.
Bioinformatics
; 34(17): i766-i772, 2018 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30423080
20.
Formula Feeding Predisposes Neonatal Piglets to Clostridium difficile Gut Infection.
J Infect Dis
; 217(9): 1442-1452, 2018 04 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29099941