Detalles de la búsqueda
1.
DDMut-PPI: predicting effects of mutations on protein-protein interactions using graph-based deep learning.
Nucleic Acids Res
; 2024 May 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38783112
2.
DDMut: predicting effects of mutations on protein stability using deep learning.
Nucleic Acids Res
; 51(W1): W122-W128, 2023 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37283042
3.
Exploring the effects of missense mutations on protein thermodynamics through structure-based approaches: findings from the CAGI6 challenges.
Hum Genet
; 2024 Jan 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38227011
4.
Structural landscapes of PPI interfaces.
Brief Bioinform
; 23(4)2022 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35656714
5.
DockNet: high-throughput protein-protein interface contact prediction.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36484688
6.
LEGO-CSM: a tool for functional characterization of proteins.
Bioinformatics
; 39(7)2023 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37382560
7.
CSM-Potential: mapping protein interactions and biological ligands in 3D space using geometric deep learning.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W204-W209, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35609999
8.
CSM-Potential2: A comprehensive deep learning platform for the analysis of protein interacting interfaces.
Proteins
; 2023 Oct 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37870486
9.
mmCSM-PPI: predicting the effects of multiple point mutations on protein-protein interactions.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W417-W424, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33893812
10.
MTR3D: identifying regions within protein tertiary structures under purifying selection.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W438-W445, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34050760
11.
mCSM-membrane: predicting the effects of mutations on transmembrane proteins.
Nucleic Acids Res
; 48(W1): W147-W153, 2020 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32469063
12.
mCSM-AB2: guiding rational antibody design using graph-based signatures.
Bioinformatics
; 36(5): 1453-1459, 2020 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31665262
13.
EasyVS: a user-friendly web-based tool for molecule library selection and structure-based virtual screening.
Bioinformatics
; 36(14): 4200-4202, 2020 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32399551
14.
pdCSM-PPI: Using Graph-Based Signatures to Identify Protein-Protein Interaction Inhibitors.
J Chem Inf Model
; 61(11): 5438-5445, 2021 11 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34719929
15.
mCSM-PPI2: predicting the effects of mutations on protein-protein interactions.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W338-W344, 2019 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31114883
16.
CSM-Toxin: A Web-Server for Predicting Protein Toxicity.
Pharmaceutics
; 15(2)2023 Jan 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36839752
17.
CSM-peptides: A computational approach to rapid identification of therapeutic peptides.
Protein Sci
; 31(10): e4442, 2022 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36173168
18.
HGDiscovery: An online tool providing functional and phenotypic information on novel variants of homogentisate 1,2- dioxigenase.
Curr Res Struct Biol
; 4: 271-277, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36118553
19.
kinCSM: Using graph-based signatures to predict small molecule CDK2 inhibitors.
Protein Sci
; 31(11): e4453, 2022 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36305769
20.
Applying Sodium Carbonate Extraction Mass Spectrometry to Investigate Defects in the Mitochondrial Respiratory Chain.
Front Cell Dev Biol
; 10: 786268, 2022.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35300415