Detalles de la búsqueda
1.
Comparative Genomics Identifies Conserved and Variable TAL Effectors in African Strains of the Cotton Pathogen Xanthomonas citri pv. malvacearum.
Phytopathology
; 113(8): 1387-1393, 2023 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37081724
2.
Naming the unnamed: over 65,000 Candidatus names for unnamed Archaea and Bacteria in the Genome Taxonomy Database.
Int J Syst Evol Microbiol
; 72(9)2022 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36125864
3.
SAR11 bacteria linked to ocean anoxia and nitrogen loss.
Nature
; 536(7615): 179-83, 2016 08 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27487207
4.
The Reliability of Metagenome-Assembled Genomes (MAGs) in Representing Natural Populations: Insights from Comparing MAGs against Isolate Genomes Derived from the Same Fecal Sample.
Appl Environ Microbiol
; 87(6)2021 02 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33452027
5.
Iterative subtractive binning of freshwater chronoseries metagenomes identifies over 400 novel species and their ecologic preferences.
Environ Microbiol
; 22(8): 3394-3412, 2020 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32495495
6.
Genome repository of oil systems: An interactive and searchable database that expands the catalogued diversity of crude oil-associated microbes.
Environ Microbiol
; 22(6): 2094-2106, 2020 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32114693
7.
Metagenomics as a Public Health Risk Assessment Tool in a Study of Natural Creek Sediments Influenced by Agricultural and Livestock Runoff: Potential and Limitations.
Appl Environ Microbiol
; 86(6)2020 03 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31924621
8.
The Microbial Genomes Atlas (MiGA) webserver: taxonomic and gene diversity analysis of Archaea and Bacteria at the whole genome level.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W282-W288, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29905870
9.
ROCker: accurate detection and quantification of target genes in short-read metagenomic data sets by modeling sliding-window bitscores.
Nucleic Acids Res
; 45(3): e14, 2017 02 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28180325
10.
How Much Do rRNA Gene Surveys Underestimate Extant Bacterial Diversity?
Appl Environ Microbiol
; 84(6)2018 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29305502
11.
Corrigendum: Naming the unnamed: over 65,000 Candidatus names for unnamed Archaea and Bacteria in the Genome Taxonomy Database.
Int J Syst Evol Microbiol
; 73(5)2023 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37171866
12.
Quantifying the Importance of the Rare Biosphere for Microbial Community Response to Organic Pollutants in a Freshwater Ecosystem.
Appl Environ Microbiol
; 83(8)2017 04 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28258138
13.
Biofilms on Hospital Shower Hoses: Characterization and Implications for Nosocomial Infections.
Appl Environ Microbiol
; 82(9): 2872-2883, 2016 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26969701
14.
MyTaxa: an advanced taxonomic classifier for genomic and metagenomic sequences.
Nucleic Acids Res
; 42(8): e73, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24589583
15.
Microbiome of the upper troposphere: species composition and prevalence, effects of tropical storms, and atmospheric implications.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(7): 2575-80, 2013 Feb 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23359712
16.
Nonpareil: a redundancy-based approach to assess the level of coverage in metagenomic datasets.
Bioinformatics
; 30(5): 629-35, 2014 Mar 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24123672
17.
Soil microbial community responses to a decade of warming as revealed by comparative metagenomics.
Appl Environ Microbiol
; 80(5): 1777-86, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24375144
18.
Quis custodiet ipsos custodes? A call for community participation in the governance of the SeqCode.
Syst Appl Microbiol
; 47(2-3): 126498, 2024 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38442686
19.
A user's guide to the bioinformatic analysis of shotgun metagenomic sequence data for bacterial pathogen detection.
Int J Food Microbiol
; 410: 110488, 2024 Jan 30.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38035404
20.
Why and how to use the SeqCode.
mLife
; 3(1): 1-13, 2024 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38827511