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1.
A Step Forward toward Selective Activation/Inhibition of Bak, a Pro-Apoptotic Member of the Bcl-2 Protein Family: Discovery of New Prospective Allosteric Sites Using Molecular Dynamics.
J Chem Inf Model
; 63(11): 3544-3556, 2023 06 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37226335
2.
Discovery of Hit Compounds Targeting the P4 Allosteric Site of K-RAS, Identified through Ensemble-Based Virtual Screening.
J Chem Inf Model
; 63(20): 6412-6422, 2023 10 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37824186
3.
α4-α5 Helices on Surface of KRAS Can Accommodate Small Compounds That Increase KRAS Signaling While Inducing CRC Cell Death.
Int J Mol Sci
; 24(1)2023 Jan 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36614192
4.
Molecular dynamics simulations of an α-synuclein NAC domain fragment with a ff14IDPSFF IDP-specific force field suggest ß-sheet intermediate states of fibrillation.
Phys Chem Chem Phys
; 24(31): 18841-18853, 2022 Aug 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35912724
5.
Effects of solvents on the conformational profile of Balaram's peptide: a computational study.
Phys Chem Chem Phys
; 24(45): 27879-27892, 2022 Nov 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36367050
6.
Discovery of Diverse Natural Products as Inhibitors of SARS-CoV-2 Mpro Protease through Virtual Screening.
J Chem Inf Model
; 61(12): 6094-6106, 2021 12 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34806382
7.
Fragment dissolved molecular dynamics: a systematic and efficient method to locate binding sites.
Phys Chem Chem Phys
; 23(4): 3123-3134, 2021 Feb 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33491698
8.
Molecular Determinants for the Activation/Inhibition of Bak Protein by BH3 Peptides.
J Chem Inf Model
; 60(3): 1632-1643, 2020 03 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31944696
9.
Modeling and subtleties of K-Ras and Calmodulin interaction.
PLoS Comput Biol
; 14(10): e1006552, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30376570
10.
Identification of Potential Small Molecule Binding Pockets in p38α MAP Kinase.
J Chem Inf Model
; 57(10): 2566-2574, 2017 10 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28872880
11.
Assessment of the Sampling Performance of Multiple-Copy Dynamics versus a Unique Trajectory.
J Chem Inf Model
; 56(10): 1950-1962, 2016 10 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27599150
12.
Atomic level rendering of DNA-drug encounter.
Biophys J
; 106(2): 421-9, 2014 Jan 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24461017
13.
Molecular topology applied to the discovery of 1-benzyl-2-(3-fluorophenyl)-4-hydroxy-3-(3-phenylpropanoyl)-2H-pyrrole-5-one as a non-ligand-binding-pocket antiandrogen.
J Chem Inf Model
; 54(10): 2953-66, 2014 Oct 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25233256
14.
Assessment of the bound conformation of bombesin to the BB1 and BB2 receptors.
Int J Biol Macromol
; 255: 127843, 2024 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37956803
15.
The Discovery of inhibitors of the SARS-CoV-2 S protein through computational drug repurposing.
Comput Biol Med
; 171: 108163, 2024 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38417382
16.
Autochthonous Peruvian Natural Plants as Potential SARS-CoV-2 Mpro Main Protease Inhibitors.
Pharmaceuticals (Basel)
; 16(4)2023 Apr 13.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37111342
17.
A hotspot for posttranslational modifications on the androgen receptor dimer interface drives pathology and anti-androgen resistance.
Sci Adv
; 9(11): eade2175, 2023 03 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36921044
18.
Molecular determinants of Bim(BH3) peptide binding to pro-survival proteins.
J Chem Inf Model
; 52(8): 2107-18, 2012 Aug 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22794663
19.
Shedding light on the binding mechanism of kinase inhibitors BI-2536, Volasetib and Ro-3280 with their pharmacological target PLK1.
J Photochem Photobiol B
; 232: 112477, 2022 Jul.
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| MEDLINE | ID: mdl-35644070
20.
Design of novel ligands of CDP-methylerythritol kinase by mimicking direct protein-protein and solvent-mediated interactions.
J Mol Recognit
; 24(1): 71-80, 2011.
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| MEDLINE | ID: mdl-20213667