Detalles de la búsqueda
1.
Detecting Protein-Ligand Interactions with Nitroxide Based Paramagnetic Cosolutes.
Chemistry
; 30(18): e202303570, 2024 Mar 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38018494
2.
Role for Carboxylic Acid Moiety in NSAIDs: Favoring the Binding at Site II of Bovine Serum Albumin.
Mol Pharm
; 21(5): 2501-2511, 2024 May 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38574292
3.
Benchmarking Water Models in Molecular Dynamics of Protein-Glycosaminoglycan Complexes.
J Chem Inf Model
; 64(5): 1691-1703, 2024 Mar 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38410841
4.
Solvent Model Benchmark for Molecular Dynamics of Glycosaminoglycans.
J Chem Inf Model
; 63(7): 2147-2157, 2023 04 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36989082
5.
Ligand binding of interleukin-8: a comparison of glycosaminoglycans and acidic peptides.
Phys Chem Chem Phys
; 25(36): 24930-24947, 2023 Sep 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37694394
6.
Studying specificity in protein-glycosaminoglycan recognition with umbrella sampling.
Beilstein J Org Chem
; 19: 1933-1946, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38170083
7.
Rapamycin-induced autophagy in osteosarcoma cells is mediated via the biglycan/Wnt/ß-catenin signaling axis.
Am J Physiol Cell Physiol
; 323(6): C1740-C1756, 2022 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36280393
8.
Explicit solvent repulsive scaling replica exchange molecular dynamics (RS-REMD) in molecular modeling of protein-glycosaminoglycan complexes.
J Comput Chem
; 43(24): 1633-1640, 2022 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35796487
9.
Molecular Dynamics Approaches Dissect Molecular Mechanisms Underlying Methylene Blue-Glycosaminoglycan Interactions.
Molecules
; 27(9)2022 Apr 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35566005
10.
Further analyses of APRIL/APRIL-receptor/glycosaminoglycan interactions by biochemical assays linked to computational studies.
Glycobiology
; 31(7): 772-786, 2021 08 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33682874
11.
Insights into the roles of charged residues in substrate binding and mode of action of mannuronan C-5 epimerase AlgE4.
Glycobiology
; 31(12): 1616-1635, 2021 12 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33822050
12.
Evaluation of replica exchange with repulsive scaling approach for docking glycosaminoglycans.
J Comput Chem
; 42(15): 1040-1053, 2021 06 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33768554
13.
Investigation of the structure of regulatory proteins interacting with glycosaminoglycans by combining NMR spectroscopy and molecular modeling - the beginning of a wonderful friendship.
Biol Chem
; 402(11): 1337-1355, 2021 10 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33882203
14.
Role of Oligosaccharide Chain Polarity in Protein-Glycosaminoglycan Interactions.
J Chem Inf Model
; 61(1): 455-466, 2021 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33375794
15.
Modeling Protein-Glycosaminoglycan Complexes: Does the Size Matter?
J Chem Inf Model
; 61(9): 4475-4485, 2021 09 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34494837
16.
Computational insights into the role of calcium ions in protein-glycosaminoglycan systems.
Phys Chem Chem Phys
; 23(5): 3519-3530, 2021 Feb 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33514968
17.
Segmented lateral dyke growth in a rifting event at Bárðarbunga volcanic system, Iceland.
Nature
; 517(7533): 191-5, 2015 Jan 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25517098
18.
Effect of Tetraphenylborate on Physicochemical Properties of Bovine Serum Albumin.
Molecules
; 26(21)2021 Oct 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34770974
19.
Coarse-grained and atomic resolution biomolecular docking with the ATTRACT approach.
Proteins
; 88(8): 1018-1028, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31785163
20.
Role of Glycosaminoglycans in Procathepsin B Maturation: Molecular Mechanism Elucidated by a Computational Study.
J Chem Inf Model
; 60(4): 2247-2256, 2020 04 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32155059